基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_023987
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 76992925-76995019
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2010 bp · LXL04_023987|LXL04_023987|OH1004|cDNA
ATGCCTGAACACGTCGGCGACCATTCGACCTCAAATCCGACCGGCGATAACATATCAACCGGCGGTTATGTCCCACACAAAGAGCTTTTCGGCTACTCTTCTCCGAGAAGCCCATTGACCACACTCAGCCCTGAGAGCGATTCAATGGGTTTATCCATTGACAGTCCTGGAGGCGTAGATACCTCCATTGAACAGCTTTATAATAACGTCTGCGAAATGCAAAGCTCCGACCAGTCACCTTCCAGGTTCAGTTACTTATC...
CDS
下载 CDS FASTA2010 bp · LXL04_023987|LXL04_023987|OH1004|CDS
ATGCCTGAACACGTCGGCGACCATTCGACCTCAAATCCGACCGGCGATAACATATCAACCGGCGGTTATGTCCCACACAAAGAGCTTTTCGGCTACTCTTCTCCGAGAAGCCCATTGACCACACTCAGCCCTGAGAGCGATTCAATGGGTTTATCCATTGACAGTCCTGGAGGCGTAGATACCTCCATTGAACAGCTTTATAATAACGTCTGCGAAATGCAAAGCTCCGACCAGTCACCTTCCAGGTTCAGTTACTTATC...
669 aa · LXL04_023987|LXL04_023987|OH1004|PROTEIN
MPEHVGDHSTSNPTGDNISTGGYVPHKELFGYSSPRSPLTTLSPESDSMGLSIDSPGGVDTSIEQLYNNVCEMQSSDQSPSRFSYLSYGQESRIDSELRFLAGGDFAKPDGGAAKDPVVIIDEKEFKETSNDSNPNQIIPGSEPSSTPKSRLPFRKKIPSKINPKKQEKISPNEDPAYLGTYLLKQARDLLSTGDNPKRAFKLAERALKSFESIQSEKPNLEVVMCLHIVAALNCSSGRYADAIPLLERSIEIPNMDQGQ...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_023987 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_023987 |
|---|---|
| 位置 | Chr05:76992925-76995019 (-) |
| 描述 | Similar to KLCR2: Protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 2 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0007368 determination of left/right symmetry 生物过程 GO:0009860 pollen tube growth 生物过程 GO:0016055 Wnt signaling pathway 生物过程 GO:0031347 regulation of defense response 生物过程 GO:0045494 photoreceptor cell maintenance 生物过程 GO:0060271 cilium assembly 生物过程 GO:0060287 epithelial cilium movement involved in determination of left/right asymmetry 生物过程 GO:0090090 negative regulation of canonical Wnt signaling pathway 生物过程 GO:2000095 regulation of Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G27500 ath:AT3G27960 ath:AT4G10840 hsa:27031 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.474
细胞核0.280
细胞膜0.167
高尔基体0.094
质体0.090
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF25063.1ARM_TT21_C307-374 aaPF13424.13TPR_12316-370 aaPF17874.8TPR_MalT316-458 aaPF24885.2TPR_NPHP3378-508 aaPF13424.13TPR_12386-459 aaPF00515.35TPR_1393-416 aaPF13414.13TPR_11394-416 aaPF13424.13TPR_12428-502 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_023987 | PF25063.1 | ARM_TT21_C | 307 | 374 | 2.2e-06 | 28.4 |
| LXL04_023987 | PF13424.13 | TPR_12 | 316 | 370 | 5.1e-47 | 158.7 |
| LXL04_023987 | PF17874.8 | TPR_MalT | 316 | 458 | 6.9e-09 | 36.1 |
| LXL04_023987 | PF24885.2 | TPR_NPHP3 | 378 | 508 | 3.8e-20 | 73.0 |
| LXL04_023987 | PF13424.13 | TPR_12 | 386 | 459 | 5.1e-47 | 158.7 |
| LXL04_023987 | PF00515.35 | TPR_1 | 393 | 416 | 2.5e-26 | 91.1 |
| LXL04_023987 | PF13414.13 | TPR_11 | 394 | 416 | 3.2e-11 | 43.5 |
| LXL04_023987 | PF13424.13 | TPR_12 | 428 | 502 | 5.1e-47 | 158.7 |
| LXL04_023987 | PF13424.13 | TPR_12 | 517 | 586 | 5.1e-47 | 158.7 |
| LXL04_023987 | PF13424.13 | TPR_12 | 556 | 626 | 5.1e-47 | 158.7 |
| LXL04_023987 | PF13374.13 | TPR_10 | 596 | 637 | 8.2e-32 | 109.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。