LXL04_023841 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_023841

当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 70500113-70501801 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

663 bp · LXL04_023841|LXL04_023841|OH1004|cDNA

ATGCCTCTTACTCCTGATTTCGATTTTCTGATCAGTACACAAACATCTCCTCCTCTCCCGATTTCGATTTTCTGGTATGGAGTAATAGGCGACGGCGATATCTTCACATCATTCACTGATTTTACGGACCGGATTTTTAGAGAGGATTGTAAAACTGTGGACGTTAAAGGTTCTCATTCAGAGCACTTGGGAGATGAGATTCTCAACTTGAGGAATACATTGTTGCAGAGTGAACTGGAGAGGGAGAGAATAGCATTGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

663 bp · LXL04_023841|LXL04_023841|OH1004|CDS

ATGCCTCTTACTCCTGATTTCGATTTTCTGATCAGTACACAAACATCTCCTCCTCTCCCGATTTCGATTTTCTGGTATGGAGTAATAGGCGACGGCGATATCTTCACATCATTCACTGATTTTACGGACCGGATTTTTAGAGAGGATTGTAAAACTGTGGACGTTAAAGGTTCTCATTCAGAGCACTTGGGAGATGAGATTCTCAACTTGAGGAATACATTGTTGCAGAGTGAACTGGAGAGGGAGAGAATAGCATTGGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

220 aa · LXL04_023841|LXL04_023841|OH1004|PROTEIN

MPLTPDFDFLISTQTSPPLPISIFWYGVIGDGDIFTSFTDFTDRIFREDCKTVDVKGSHSEHLGDEILNLRNTLLQSELERERIALELEEEKKAQAERDKMLQESGELTEVKAEYEKLLMEFEAERTMNKIQIDNLTRRLADATSCLDEEPRVSYTSNSDISLTELEASIQVLEKALSLQNLESVVELETEKDKEASNKYEKLYMELMAAKEEACLEMLL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_023841`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_023841

位置 Chr05:70500113-70501801 (-)

描述 Similar to KIN7O: Kinesin-like protein KIN-7O

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: F4J2K4`	类驱动蛋白 KIN-7O。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os09g0421200`	类动力蛋白 KIN-7I。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023841 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程

GO:0000278 mitotic cell cycle 生物过程

GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程

GO:0008608 attachment of spindle microtubules to kinetochore 生物过程

GO:0033044 regulation of chromosome organization 生物过程

GO:0042327 positive regulation of phosphorylation 生物过程

GO:0140694 membraneless organelle assembly 生物过程

GO:1901987 regulation of cell cycle phase transition 生物过程

GO:0000776 kinetochore 细胞组分

GO:0000779 condensed chromosome, centromeric region 细胞组分

GO:0005635 nuclear envelope 细胞组分

GO:0005694 chromosome 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G10180

dosa:Os09g0421200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.564

排名 1 · LXL04_023841 · OH-1004

细胞核0.332

排名 2 · LXL04_023841 · OH-1004

细胞膜0.121

排名 3 · LXL04_023841 · OH-1004

高尔基体0.087

排名 4 · LXL04_023841 · OH-1004

内质网0.058

排名 5 · LXL04_023841 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4J2K4`	拟南芥	Kinesin-like protein KIN-7O	75.000%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`B9G3M6`	水稻	Kinesin-like protein KIN-7I	66.071%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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