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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_022748
当前版本: OH-1004 染色体: Chr05 坐标: 7474779-7488642 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4392 bp · LXL04_022748|LXL04_022748|OH1004|cDNA

ATGCATAGCCGAGCTATTGGCTGGCTACACTTCGGTGTACATATGTGTGTCATTCTCATTCAGCATTCATATCCCCTTTTAGCTCTATTTTTTCACTTGATAAACACAAACATCATGTCTTCATCAGCCAACAAAAAGTTTGCTCACTTACAGATCCCACTTGAAGAGATACAATCTGCCACCAGAAACTTTTCCAAACAGAATTTCATAAAAAAGGCGGTAATAGGAAACGTTTACAGAGGACAACTGTCAAGGTCCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

4392 bp · LXL04_022748|LXL04_022748|OH1004|CDS

ATGCATAGCCGAGCTATTGGCTGGCTACACTTCGGTGTACATATGTGTGTCATTCTCATTCAGCATTCATATCCCCTTTTAGCTCTATTTTTTCACTTGATAAACACAAACATCATGTCTTCATCAGCCAACAAAAAGTTTGCTCACTTACAGATCCCACTTGAAGAGATACAATCTGCCACCAGAAACTTTTCCAAACAGAATTTCATAAAAAAGGCGGTAATAGGAAACGTTTACAGAGGACAACTGTCAAGGTCCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1463 aa · LXL04_022748|LXL04_022748|OH1004|PROTEIN

MHSRAIGWLHFGVHMCVILIQHSYPLLALFFHLINTNIMSSSANKKFAHLQIPLEEIQSATRNFSKQNFIKKAVIGNVYRGQLSRSGQKIDILAQRIDCSSGFGDIELWREILTLSRLGSHRNLSSVIGFFNEKNEKIIIRKQEANGSLDQCLADPTLTWMRRLRICVGVAQALSYMYYQKGRDFSVIHCDITSSKILLDDQWQPKLSGFEFSLTQTIDRRNDPCLTDIWGFSTCDPVCAEERSVSHKSEVYSLGVVLME...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_022748
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_022748
位置Chr05:7474779-7488642 (+)
描述Similar to At5g59700: Probable receptor-like protein kinase At5g59700
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g59700 可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。 暂无已核实直接文献
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At2g23200 可能的受体样蛋白激酶At2g23200。 暂无已核实直接文献
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位，参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
FERONIA receptor-like kinase regulates RHO GTPase signaling of root hair development.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005366107
At5g61350 可能的受体样蛋白激酶 At5g61350。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022748 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0043680 filiform apparatus 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G46290
ath:AT5G59700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.441
排名 1 · LXL04_022748 · OH-1004
细胞膜0.398
排名 2 · LXL04_022748 · OH-1004
细胞核0.290
排名 3 · LXL04_022748 · OH-1004
内质网0.053
排名 4 · LXL04_022748 · OH-1004
高尔基体0.041
排名 5 · LXL04_022748 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr70-329 aa
PF00069.32Pkinase106-327 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr412-662 aa
PF00069.32Pkinase451-716 aa
PF00069.32Pkinase748-1013 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr750-1014 aa
PF14299.14PP21082-1200 aa
PF14299.14PP21300-1462 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_022748PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr703292.7e-104348.8
LXL04_022748PF00069.32Pkinase1063275.3e-91305.4
LXL04_022748PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr4126622.7e-104348.8
LXL04_022748PF00069.32Pkinase4517165.3e-91305.4
LXL04_022748PF00069.32Pkinase74810135.3e-91305.4
LXL04_022748PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr75010142.7e-104348.8
LXL04_022748PF14299.14PP2108212002.6e-35122.3
LXL04_022748PF14299.14PP2130014622.6e-35122.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FN92拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g5970040.351%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LX66拟南芥Receptor-like protein kinase HERK 139.385%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
O22187拟南芥Probable receptor-like protein kinase At2g2320041.742%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SCZ4拟南芥Receptor-like protein kinase FERONIA35.680%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FLJ8拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g6135038.187%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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