基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_022710
当前版本: OH-1004
染色体: Chr05
坐标: 6134957-6153265
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA8481 bp · LXL04_022710|LXL04_022710|OH1004|cDNA
ATGGACAGTGGAAAAGGAAAAAGTGGTGGTGGTTATGGCCATGTAAATAACAAGGCTAATTATACCGATAGCCACGATGTGGACGCTCTTTTGGAGAAAGCATGTTTAGATAGAGAAAAAGATTTGGATAAATTAATGAATCCATACGGTGTTGTTACAGATGACACATATGAATTTCCTCCACTAGCTGCCATTCAAGTAAATCATGATCCCAATAATCTAGAAGAGGGACGTTCACCGTATTACACCGAACAATATTA...
CDS
下载 CDS FASTA8481 bp · LXL04_022710|LXL04_022710|OH1004|CDS
ATGGACAGTGGAAAAGGAAAAAGTGGTGGTGGTTATGGCCATGTAAATAACAAGGCTAATTATACCGATAGCCACGATGTGGACGCTCTTTTGGAGAAAGCATGTTTAGATAGAGAAAAAGATTTGGATAAATTAATGAATCCATACGGTGTTGTTACAGATGACACATATGAATTTCCTCCACTAGCTGCCATTCAAGTAAATCATGATCCCAATAATCTAGAAGAGGGACGTTCACCGTATTACACCGAACAATATTA...
2826 aa · LXL04_022710|LXL04_022710|OH1004|PROTEIN
MDSGKGKSGGGYGHVNNKANYTDSHDVDALLEKACLDREKDLDKLMNPYGVVTDDTYEFPPLAAIQVNHDPNNLEEGRSPYYTEQYYFVTASPRPKPKSLPLDMNTEILRLVDSAIMGQPESIDTLKNKVSGVEDCGDGFDQESFSFLLVDTLLTTMGGVESFDEDDDDNNKPSVMKNSKAAIISGELIPWLPWLTDSVGFMSPRTRLVRGLRTILHACTRNRALCCAAGLTMVLLETAEKIFLDDVGSTKQLHWNGGPL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_022710 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_022710 |
|---|---|
| 位置 | Chr05:6134957-6153265 (+) |
| 描述 | Similar to BCHC2: BEACH domain-containing protein C2 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G45540 ath:AT3G60920 ddi:DDB_G0280971 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.417
细胞膜0.280
细胞核0.266
高尔基体0.132
溶酶体／液泡0.104
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF15787.12DUF4704569-871 aaPF15787.12DUF47041026-1161 aaPF14844.13PH_BEACH1971-2056 aaPF02138.24Beach2085-2361 aaPF24814.2WD40_Prp192472-2570 aaPF25175.2Beta-prop_WDR52480-2644 aaPF24807.2WD40_CDC20-Fz2480-2553 aaPF20426.5NBCH_WD402483-2697 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_022710 | PF15787.12 | DUF4704 | 569 | 871 | 1.8e-64 | 219.1 |
| LXL04_022710 | PF15787.12 | DUF4704 | 1026 | 1161 | 1.8e-64 | 219.1 |
| LXL04_022710 | PF14844.13 | PH_BEACH | 1971 | 2056 | 1.6e-21 | 77.0 |
| LXL04_022710 | PF02138.24 | Beach | 2085 | 2361 | 1.3e-115 | 386.2 |
| LXL04_022710 | PF24814.2 | WD40_Prp19 | 2472 | 2570 | 9.1e-10 | 38.8 |
| LXL04_022710 | PF25175.2 | Beta-prop_WDR5 | 2480 | 2644 | 4e-11 | 43.5 |
| LXL04_022710 | PF24807.2 | WD40_CDC20-Fz | 2480 | 2553 | 1.2e-09 | 38.6 |
| LXL04_022710 | PF20426.5 | NBCH_WD40 | 2483 | 2697 | 1.4e-19 | 70.9 |
| LXL04_022710 | PF23414.2 | Beta-prop_EML_2 | 2483 | 2553 | 3.4e-07 | 30.6 |
| LXL04_022710 | PF25173.2 | Beta-prop_WDR3_1st | 2484 | 2550 | 3.3e-13 | 50.5 |
| LXL04_022710 | PF24817.2 | WD40_WDHD1_1st | 2485 | 2564 | 7.5e-10 | 39.2 |
| LXL04_022710 | PF25172.2 | Beta-prop_WDR3_2nd | 2485 | 2566 | 4.2e-07 | 30.2 |
| LXL04_022710 | PF25174.2 | Beta-prop_THOC3 | 2489 | 2551 | 5.2e-10 | 39.5 |
| LXL04_022710 | PF23381.2 | Beta-prop_IFT122_1st | 2491 | 2551 | 2.3e-12 | 47.5 |
| LXL04_022710 | PF25047.1 | Beta-prop_TEP1_2nd | 2509 | 2552 | 2.7e-08 | 34.0 |
| LXL04_022710 | PF00400.39 | WD40 | 2516 | 2548 | 8.8e-14 | 52.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。