基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_022203
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 146011028-146013710
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2163 bp · LXL04_022203|LXL04_022203|OH1004|cDNA
ATGAGTTCGGTAACGCTTTCCCCAGCTTCGACTACATCACCGGGAAACCCATCGGGTTTCTATCGGAACAGGAGGACGGCGAGGACCACAAACATCATCCCTAAATGTCGGACCAGATTTAGGGCGAAACCCTTATCTGCAGCGCTGGTTGAGGAAGCGAGACCTCGCGCTTTGCCTCCGGTTAGAAGTAATAACAGTATTAACGGTGCCGGCGGAGAAGCAAACCTCTCTTCCATAGTTCTGGCGAAAGATAGAGCAGA...
CDS
下载 CDS FASTA2163 bp · LXL04_022203|LXL04_022203|OH1004|CDS
ATGAGTTCGGTAACGCTTTCCCCAGCTTCGACTACATCACCGGGAAACCCATCGGGTTTCTATCGGAACAGGAGGACGGCGAGGACCACAAACATCATCCCTAAATGTCGGACCAGATTTAGGGCGAAACCCTTATCTGCAGCGCTGGTTGAGGAAGCGAGACCTCGCGCTTTGCCTCCGGTTAGAAGTAATAACAGTATTAACGGTGCCGGCGGAGAAGCAAACCTCTCTTCCATAGTTCTGGCGAAAGATAGAGCAGA...
720 aa · LXL04_022203|LXL04_022203|OH1004|PROTEIN
MSSVTLSPASTTSPGNPSGFYRNRRTARTTNIIPKCRTRFRAKPLSAALVEEARPRALPPVRSNNSINGAGGEANLSSIVLAKDRADDIQAESKALARASNASVYSPELLKNKYSSRPFKVLQRTLQIVVGLGSFGLKLWIDQLQGQLVQNRRSRAIELRETFTRLGPTFVKLGQGLSTRPDLCPPEFLEELSELQDALPTFPDAEAFACIEKELGIPLDSIYTSISTSPIAAASLGQVYKAKLKKSGQLVAVKVQRPGI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_022203 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_022203 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:146011028-146013710 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to ABC1K3: Protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 3, chloroplastic | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009637 response to blue light 生物过程 GO:0009644 response to high light intensity 生物过程 GO:0009658 chloroplast organization 生物过程 GO:0009767 photosynthetic electron transport chain 生物过程 GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程 GO:0010109 regulation of photosynthesis 生物过程 GO:0010114 response to red light 生物过程 GO:0015996 chlorophyll catabolic process 生物过程 GO:0031540 regulation of anthocyanin biosynthetic process 生物过程 GO:0050821 protein stabilization 生物过程 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G71810 ath:AT1G79600 ath:AT4G31390 syn:sll0005 syn:slr1919 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
质体0.989
线粒体0.020
细胞质0.013
过氧化物酶体0.013
细胞膜0.012
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF03109.23ABC1195-438 aaPF30507.1ABC1K3_C592-709 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_022203 | PF03109.23 | ABC1 | 195 | 438 | 2.2e-74 | 250.5 |
| LXL04_022203 | PF30507.1 | ABC1K3_C | 592 | 709 | 6.9e-30 | 104.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9MA15 | 拟南芥 | Protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 3, chloroplastic | 79.245% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q94BU1 | 拟南芥 | Uncharacterized aarF domain-containing protein kinase At1g71810, chloroplastic | 39.821% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q8RWG1 | 拟南芥 | Protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 1, chloroplastic | 37.225% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |