基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_021996
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 142238465-142241705
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2109 bp · LXL04_021996|LXL04_021996|OH1004|cDNA
ATGAGGAGTATCACAGTGAACAGGAATGCTCCGGCAACTAGAGGGTTAGCCGAGCTCAACCACCATAACCGGGAGGAACTCAAGCAAGTCAGAAATGGAACCGCTCTTAATGGTCAATGGCTGTCTGAAGAAGACGAGACAAAAATCAACGAAGATGTCAACAGTGGTAGACAATTTGAGCTAATTCAGCCACACGATGCTCTCCATAGACAACATCAACCACATCAACCACATCAAGGCTCCATGGTTGAATGGGAACG...
CDS
下载 CDS FASTA2109 bp · LXL04_021996|LXL04_021996|OH1004|CDS
ATGAGGAGTATCACAGTGAACAGGAATGCTCCGGCAACTAGAGGGTTAGCCGAGCTCAACCACCATAACCGGGAGGAACTCAAGCAAGTCAGAAATGGAACCGCTCTTAATGGTCAATGGCTGTCTGAAGAAGACGAGACAAAAATCAACGAAGATGTCAACAGTGGTAGACAATTTGAGCTAATTCAGCCACACGATGCTCTCCATAGACAACATCAACCACATCAACCACATCAAGGCTCCATGGTTGAATGGGAACG...
702 aa · LXL04_021996|LXL04_021996|OH1004|PROTEIN
MRSITVNRNAPATRGLAELNHHNREELKQVRNGTALNGQWLSEEDETKINEDVNSGRQFELIQPHDALHRQHQPHQPHQGSMVEWERFLPLRSLKVLLVENDDSTRHIVSALLRNCSYEVTAVANGIEAWKVLIDLNKQIDIVLTEVLMPYLSGIGLLTKIMNHVPRKNVPVIMMSSDDSMGIVFNCLSKGAVDFLVKPIRKNELKNLWQHVWRKCHSQSSGSGSESGIGTRKSAKSLTNKESDDDDDVDDDDSDTSDED...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_021996 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_021996 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:142238465-142241705 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to APRR7: Two-component response regulator-like APRR7 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000160 phosphorelay signal transduction system 生物过程 GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0007623 circadian rhythm 生物过程 GO:0009585 red, far-red light phototransduction 生物过程 GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009908 flower development 生物过程 GO:0010017 red or far-red light signaling pathway 生物过程 GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0048511 rhythmic process 生物过程 GO:0048579 negative regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G02810 dosa:Os03g0284100 dosa:Os07g0695100 osa:4344399 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.936
细胞质0.099
细胞膜0.052
内质网0.022
质体0.010
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00072.31Response_reg96-207 aaPF06203.20CCT647-689 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_021996 | PF00072.31 | Response_reg | 96 | 207 | 3.7e-19 | 69.7 |
| LXL04_021996 | PF06203.20 | CCT | 647 | 689 | 1.2e-17 | 64.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q93WK5 | 拟南芥 | Two-component response regulator-like APRR7 | 43.001% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
A2XFB7 | 水稻 | Two-component response regulator-like PRR73 | 41.032% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q10N34 | 水稻 | Two-component response regulator-like PRR73 | 40.774% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
A2YQ93 | 水稻 | Two-component response regulator-like PRR37 | 41.560% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q0D3B6 | 水稻 | Two-component response regulator-like PRR37 | 41.727% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |