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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_021017
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 119143306-119147242 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1749 bp · LXL04_021017|LXL04_021017|OH1004|cDNA

ATGGATTCGGTGTCGATCCGTGTGCCTTACAAAAACCTCAAGCATGATGCGGATGCGGAGGTTGAAATGATGAGTTTCGAGGTAGAACCTAATCCACGGATCGAATCCGATAGTTCGAATAGATTTTCTAATGGACATGACTCCAGTTATTCTTCTTCACCGCAAGGAGCGCCGACGGAGAATTGTAGCTTAATTACGTTAATTTTGAGTTGTACGGTGGCTGCCGGCGTTCAGTTTGGTTGGGCCTTGCAACTATCGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1749 bp · LXL04_021017|LXL04_021017|OH1004|CDS

ATGGATTCGGTGTCGATCCGTGTGCCTTACAAAAACCTCAAGCATGATGCGGATGCGGAGGTTGAAATGATGAGTTTCGAGGTAGAACCTAATCCACGGATCGAATCCGATAGTTCGAATAGATTTTCTAATGGACATGACTCCAGTTATTCTTCTTCACCGCAAGGAGCGCCGACGGAGAATTGTAGCTTAATTACGTTAATTTTGAGTTGTACGGTGGCTGCCGGCGTTCAGTTTGGTTGGGCCTTGCAACTATCGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

582 aa · LXL04_021017|LXL04_021017|OH1004|PROTEIN

MDSVSIRVPYKNLKHDADAEVEMMSFEVEPNPRIESDSSNRFSNGHDSSYSSSPQGAPTENCSLITLILSCTVAAGVQFGWALQLSLLTPYIQTLGIGHAFSSFIWLCGPITGLVVQPCVGIWSDRCTSKYGRRRPFILVGSLMISIAVITIGFSADIGYLIGDTKEHCSVYKGTRTRAAFVFIIGFWMLDLANNTVQGPARALLADLAGPDQRNSANAIFCSWMAIGNILGFLSGSSGNWHRWFPFLKSRACCEACGNL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_021017
TK1151 IDTkA05G342690
OH-1004 IDLXL04_021017
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.866 / OH-1004 73.024
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_021017
位置Chr04:119143306-119147242 (-)
描述Similar to SUC3: Sucrose transport protein SUC3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g02860 负责将蔗糖运输到细胞中，并伴随着质子的摄取。
AtSUC3, a gene encoding a new Arabidopsis sucrose transporter, is expressed in cells adjacent to the vascular tissue and in a carpel cell layer.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00934.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0827200 负责将蔗糖运输到细胞中，并伴随着质子的摄取（对称运输系统）。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8AF63 负责将蔗糖运输到细胞中，并伴随着质子的摄取（对称运输系统）。 暂无已核实直接文献
Os03g0170900 负责将蔗糖运输到细胞中，并伴随着质子的摄取。
Transport activity of rice sucrose transporters OsSUT1 and OsSUT5.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcp172
Disruption of a gene for rice sucrose transporter, OsSUT1, impairs pollen function but pollen maturation is unaffected.2010 · DOI: 10.1093/jxb/erq175
cDNA cloning and tissue specific expression of a gene for sucrose transporter from rice (Oryza sativa L.).1997 · DOI: 10.1093/oxfordjournals.pcp.a029134
UniProt: Q9LKH3 负责将蔗糖运输到细胞中，并伴随着质子的摄取（对称运输系统）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021017 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005985 sucrose metabolic process 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0015768 maltose transport 生物过程
GO:0015770 sucrose transport 生物过程
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0005364 maltose:proton symporter activity 分子功能
GO:0008506 sucrose:proton symporter activity 分子功能
GO:0008515 sucrose transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G02860
dosa:Os02g0827200
dosa:Os03g0170900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.417
排名 1 · LXL04_021017 · OH-1004
细胞膜0.300
排名 2 · LXL04_021017 · OH-1004
细胞质0.211
排名 3 · LXL04_021017 · OH-1004
高尔基体0.128
排名 4 · LXL04_021017 · OH-1004
内质网0.118
排名 5 · LXL04_021017 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690.22MFS_173-377 aa
PF13347.13MFS_280-294 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_021017PF07690.22MFS_1733773.4e-1556.5
LXL04_021017PF13347.13MFS_2802943.1e-0833.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80605拟南芥Sucrose transport protein SUC369.767%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q6YK44水稻Sucrose transport protein SUT465.882%Swiss-Prot强数据库同源证据
B8AF63水稻Sucrose transport protein SUT465.882%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q10R54水稻Sucrose transport protein SUT157.611%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LKH3水稻Sucrose transport protein SUT157.611%Swiss-Prot强数据库同源证据

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