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基因概览

LXL04_018881

当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 19577076-19577814 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

369 bp · LXL04_018881|LXL04_018881|OH1004|cDNA

ATGGCGATTTCGACCAACTTGCTTCTTCTCATGGTAGCAATCTCCGCCATAACGTTATCTTCTTTCACCAGTCCGGCTGCCGGCTCTAGCGGCGGAGATGAGTTTAGCTGGATCTCGAAGCAGGGAGgcggaggaggaggaggatgcAGGGGGTCAATCGCCGAGTGTATGGGAGCTGGAGAACTGGAGATGGAATCGGAAAGCACTAGGCGTATATTAGCGACGACTAACTACATAAGCTATGGAGCGCTGCAAGGGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

369 bp · LXL04_018881|LXL04_018881|OH1004|CDS

ATGGCGATTTCGACCAACTTGCTTCTTCTCATGGTAGCAATCTCCGCCATAACGTTATCTTCTTTCACCAGTCCGGCTGCCGGCTCTAGCGGCGGAGATGAGTTTAGCTGGATCTCGAAGCAGGGAGGCGGAGGAGGAGGAGGATGCAGGGGGTCAATCGCCGAGTGTATGGGAGCTGGAGAACTGGAGATGGAATCGGAAAGCACTAGGCGTATATTAGCGACGACTAACTACATAAGCTATGGAGCGCTGCAAGGGAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

122 aa · LXL04_018881|LXL04_018881|OH1004|PROTEIN

MAISTNLLLLMVAISAITLSSFTSPAAGSSGGDEFSWISKQGGGGGGGCRGSIAECMGAGELEMESESTRRILATTNYISYGALQGNNVPCSQRDSMMNQLHRACYPFLFEISVHIYILYLF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_018881`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_018881

位置 Chr04:19577076-19577814 (+)

描述 Similar to RALF1: Protein RALF-like 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g02900`	可能调节植物胁迫、生长和发育的细胞信号肽。	A cytoplasmic Ca2+ functional assay for identifying and purifying endogenous cell signaling peptides in Arabidopsis seedlings: identification of AtRALF1 peptide.2008 · DOI: 10.1021/bi8001488 A conserved dibasic site is essential for correct processing of the peptide hormone AtRALF1 in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1016/j.febslet.2008.08.025
`At4g15800`	可能调节植物胁迫、生长和发育的细胞信号肽。	暂无已核实直接文献
`At3g16570`	可能调节植物胁迫、生长和发育的细胞信号肽。	Regulation and processing of a plant peptide hormone, AtRALF23, in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03926.x
`At3g05490`	可能调节植物胁迫、生长和发育的细胞信号肽。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018881 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007267 cell-cell signaling 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0010469 regulation of signaling receptor activity 生物过程

GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程

GO:0030308 negative regulation of cell growth 生物过程

GO:0040008 regulation of growth 生物过程

GO:0045926 negative regulation of growth 生物过程

GO:0048364 root development 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G02900

ath:AT3G05490

ath:AT3G16570

ath:AT4G15800

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.381

排名 1 · LXL04_018881 · OH-1004

细胞膜0.327

排名 2 · LXL04_018881 · OH-1004

内质网0.162

排名 3 · LXL04_018881 · OH-1004

细胞质0.103

排名 4 · LXL04_018881 · OH-1004

细胞核0.073

排名 5 · LXL04_018881 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05498.17RALF61-95 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_018881	`PF05498.17`	RALF	61	95	2e-10	42.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SRY3`	拟南芥	Protein RALF-like 1	45.745%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q8L9P8`	拟南芥	Protein RALF-like 33	43.158%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9LUS7`	拟南芥	Rapid alkalinization factor 23	37.273%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9MA62`	拟南芥	Protein RALF-like 22	39.130%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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