基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_018081
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 6291083-6298585
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1893 bp · LXL04_018081|LXL04_018081|OH1004|cDNA
ATGGTGAAGACTGCTCCTCTATCAACATGGCCTTGGGAAAATCTTGGCATTTTCAAGTATATGTTGCTTGGACCATTGGTGGGAAAGGTTATGCATTCAAGACTTGAAGGGGATGATAATCTAGCAAGCAATTGGTGTTTTCAAGTTCTCCTGATAAGCTTGATTAGATTTAATATATACATGTGGTATACCAACACATGTAACATGCTTTTCCTCACCCGAAACCGTCGGATTTTTACAAAAGGCGTTGACTTTAATCA...
CDS
下载 CDS FASTA1893 bp · LXL04_018081|LXL04_018081|OH1004|CDS
ATGGTGAAGACTGCTCCTCTATCAACATGGCCTTGGGAAAATCTTGGCATTTTCAAGTATATGTTGCTTGGACCATTGGTGGGAAAGGTTATGCATTCAAGACTTGAAGGGGATGATAATCTAGCAAGCAATTGGTGTTTTCAAGTTCTCCTGATAAGCTTGATTAGATTTAATATATACATGTGGTATACCAACACATGTAACATGCTTTTCCTCACCCGAAACCGTCGGATTTTTACAAAAGGCGTTGACTTTAATCA...
630 aa · LXL04_018081|LXL04_018081|OH1004|PROTEIN
MVKTAPLSTWPWENLGIFKYMLLGPLVGKVMHSRLEGDDNLASNWCFQVLLISLIRFNIYMWYTNTCNMLFLTRNRRIFTKGVDFNQIDKEWDWDNFLILQALIASLAILLFPNGFANMPVWEAKGFVAVLVLHVLVSEPLYYWMHRLLHGNYLYAPYHSFHHLSAVPQPVTAGSTTFLEGLLVTTVIGLPLFGCCMFGFGSKTVIYSYVFVFDFLCCFGHSNVEIMPHRIFGKFPFFKYLLYTPTYYSLHHTEKSTNYC...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_018081 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_018081 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:6291083-6298585 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to CER3: Very-long-chain aldehyde decarbonylase CER3 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0008610 lipid biosynthetic process 生物过程 GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009611 response to wounding 生物过程 GO:0009651 response to salt stress 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0010025 wax biosynthetic process 生物过程 GO:0010143 cutin biosynthetic process 生物过程 GO:0043447 alkane biosynthetic process 生物过程 GO:0046184 aldehyde biosynthetic process 生物过程 GO:0048235 pollen sperm cell differentiation 生物过程 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G57800 dosa:Os02g0178800 dosa:Os06g0653000 dosa:Os09g0426800 osa:4328496 osa:4341702 osa:4347115 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
内质网0.609
线粒体0.196
细胞质0.087
细胞核0.080
细胞膜0.054
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF04116.20FA_hydroxylase132-272 aaPF12076.14CER1-like_C454-624 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_018081 | PF04116.20 | FA_hydroxylase | 132 | 272 | 5e-18 | 66.5 |
| LXL04_018081 | PF12076.14 | CER1-like_C | 454 | 624 | 2.7e-67 | 226.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8H1Z0 | 拟南芥 | Very-long-chain aldehyde decarbonylase CER3 | 64.331% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q6ETL8 | 水稻 | Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-2 | 60.828% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
B8AIW3 | 水稻 | Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-2 | 60.669% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q67WQ7 | 水稻 | Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-3 | 61.859% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q69PA8 | 水稻 | Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-1 | 58.966% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |