LXL04_017249 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_017249

当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 144334637-144336721 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2085 bp · LXL04_017249|LXL04_017249|OH1004|cDNA

ATGATCCATCAAATTACATCCTTCCTTCTTATATTGATCCCTTATGCAGCTTCATTTTCCTTTGATTTGACAAATATCAGCCCAGAGAATCAGAATAGGGACATAGTAACAGAAGGTGACGGAGCTTATATCTCCGACAGTGGAATCCAGGTGACCCCAGATGGAATTGGTTCTAATCGGAGCTTAAAAGCAGGAAGAGCAAGATACATCAGACCGTTTCATCTTTGGGACAACAAATCAAACGAGCTTGCAAGCTTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2085 bp · LXL04_017249|LXL04_017249|OH1004|CDS

ATGATCCATCAAATTACATCCTTCCTTCTTATATTGATCCCTTATGCAGCTTCATTTTCCTTTGATTTGACAAATATCAGCCCAGAGAATCAGAATAGGGACATAGTAACAGAAGGTGACGGAGCTTATATCTCCGACAGTGGAATCCAGGTGACCCCAGATGGAATTGGTTCTAATCGGAGCTTAAAAGCAGGAAGAGCAAGATACATCAGACCGTTTCATCTTTGGGACAACAAATCAAACGAGCTTGCAAGCTTTTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

694 aa · LXL04_017249|LXL04_017249|OH1004|PROTEIN

MIHQITSFLLILIPYAASFSFDLTNISPENQNRDIVTEGDGAYISDSGIQVTPDGIGSNRSLKAGRARYIRPFHLWDNKSNELASFSTNFTFVIDSNGNTAYADGLTFFLAQNNSVISPGGSMGLPVNGTTINSTNPFVAVEFDTFQNRNWDPRDSNNTLIGDHVGISISSLASVRHQKWFSNITGGRVCQAWIAYDSVSQNLSVSFTGFRNNTIVRQVGLEYTVDLRAVLPETVIFGFSAATGALFEKNNVRSWSFSGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_017249`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_017249

位置 Chr03:144334637-144336721 (-)

描述 Similar to LECRK91: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g10530`	促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。	暂无已核实直接文献
`At5g65600`	促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。	暂无已核实直接文献
`At5g55830`	参与对病原卵菌马铃薯晚疫病菌和辣椒晚疫病菌的抗性反应。	暂无已核实直接文献
`At3g55550`	参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。	暂无已核实直接文献
`At5g06740`	可能的L型凝集素结构域受体激酶 S.5。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017249 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0009862 systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程

GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G55550

ath:AT5G06740

ath:AT5G10530

ath:AT5G55830

ath:AT5G65600

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.834

排名 1 · LXL04_017249 · OH-1004

内质网0.090

排名 2 · LXL04_017249 · OH-1004

细胞质0.077

排名 3 · LXL04_017249 · OH-1004

细胞核0.045

排名 4 · LXL04_017249 · OH-1004

溶酶体／液泡0.040

排名 5 · LXL04_017249 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00139.27Lectin_legB20-267 aa

PF18483.9Lectin_L-type_dom80-253 aa

PF00069.32Pkinase358-624 aa

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr360-626 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_017249	`PF00139.27`	Lectin_legB	20	267	8.2e-60	203.1
LXL04_017249	`PF18483.9`	Lectin_L-type_dom	80	253	6e-11	43.3
LXL04_017249	`PF00069.32`	Pkinase	358	624	3.1e-52	178.3
LXL04_017249	`PF07714.24`	PK_Tyr_Ser-Thr	360	626	6e-50	170.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LXA5`	拟南芥	L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1	45.552%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9LSL5`	拟南芥	L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.2	45.253%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9FHG4`	拟南芥	Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.7	41.558%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9M2S4`	拟南芥	L-type lectin-domain containing receptor kinase S.4	40.925%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9FG33`	拟南芥	Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.5	39.968%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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