基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_017151
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 142088746-142097196
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3177 bp · LXL04_017151|LXL04_017151|OH1004|cDNA
ATGGCTTCCATTAACATGGCGTCGTCTTCCTCCTCGCAACTACTACGCCTCAAGATGAACACAAACTTTAGTTCGTTCAGTGGTCTTCACTCTCTAAACATTCTTTCCCAAAACACCAAATTGTGCTCCATAAGTAAATCCGATTGTTTATTCAAATCTTCATTCTTACCGGTCGATTCATGGAAAACTGCTGTTAGCCTTCCATCTGGGATTGAAATACAGACTGATTCAACAATTTTGACGACACTAGAAGAAGAATT...
CDS
下载 CDS FASTA3177 bp · LXL04_017151|LXL04_017151|OH1004|CDS
ATGGCTTCCATTAACATGGCGTCGTCTTCCTCCTCGCAACTACTACGCCTCAAGATGAACACAAACTTTAGTTCGTTCAGTGGTCTTCACTCTCTAAACATTCTTTCCCAAAACACCAAATTGTGCTCCATAAGTAAATCCGATTGTTTATTCAAATCTTCATTCTTACCGGTCGATTCATGGAAAACTGCTGTTAGCCTTCCATCTGGGATTGAAATACAGACTGATTCAACAATTTTGACGACACTAGAAGAAGAATT...
1058 aa · LXL04_017151|LXL04_017151|OH1004|PROTEIN
MASINMASSSSSQLLRLKMNTNFSSFSGLHSLNILSQNTKLCSISKSDCLFKSSFLPVDSWKTAVSLPSGIEIQTDSTILTTLEEELNSFPRDVHGYDLDSPTPGFSSIPEAIEDIRQGKMVVVVDDEDRENEGDLIMAASSVTPEAMAFFVKHGTGIVCVSMKAEDLERLQLPLMVTRNQDKNRTAFTVSVDCKHHTTTGVSANDRATTIKALASKESKPDDFNRPGHIFPLKYREGGVLKRAGHTEASVDLAILAGFD...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_017151 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_017151 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:142088746-142097196 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to RIBA1: Bifunctional riboflavin biosynthesis protein RIBA 1, chloroplastic | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009231 riboflavin biosynthetic process 生物过程 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分 GO:0003935 GTP cyclohydrolase II activity 分子功能 GO:0005525 GTP binding 分子功能 GO:0008686 3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase activity 分子功能 GO:0046872 metal ion binding 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G64300 dosa:Os02g0572400 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
质体0.962
线粒体0.063
细胞质0.029
细胞核0.019
过氧化物酶体0.016
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00926.25DHBP_synthase111-301 aaPF00925.26GTP_cyclohydro2314-477 aaPF00926.25DHBP_synthase645-835 aaPF00925.26GTP_cyclohydro2845-1011 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_017151 | PF00926.25 | DHBP_synthase | 111 | 301 | 1.2e-178 | 589.9 |
| LXL04_017151 | PF00925.26 | GTP_cyclohydro2 | 314 | 477 | 4.1e-144 | 476.1 |
| LXL04_017151 | PF00926.25 | DHBP_synthase | 645 | 835 | 1.2e-178 | 589.9 |
| LXL04_017151 | PF00925.26 | GTP_cyclohydro2 | 845 | 1011 | 4.1e-144 | 476.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
P47924 | 拟南芥 | Bifunctional riboflavin biosynthesis protein RIBA 1, chloroplastic | 79.727% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q6NLQ7 | 拟南芥 | Monofunctional riboflavin biosynthesis protein RIBA 2, chloroplastic | 69.378% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FN89 | 拟南芥 | Monofunctional riboflavin biosynthesis protein RIBA 3, chloroplastic | 62.673% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q6Z234 | 水稻 | Probable bifunctional riboflavin biosynthesis protein RIBA 1, chloroplastic | 75.676% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q0E079 | 水稻 | Probable bifunctional riboflavin biosynthesis protein RIBA 2, chloroplastic | 79.319% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |