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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_012319
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 10333438-10345613 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

6876 bp · LXL04_012319|LXL04_012319|OH1004|cDNA

ATGTGTAATGCTACTCACCATTTTCAGCCAGCAACATGCAAGTATCCTTGTACTTGTAAGTTTAGTTCCAAAATGAACTCTCGTGTTGCTATTCTCTTCTCTCTTCTTATCATATCTCTGATTGCCTCCACCATCTCTGCTTCCAATGAGGGTAATGAGACCGATTACCAGGCGTTAATGCAGTTCAAGTCACTGGTCAGAAATGAAGGTCTAAGGTCATGGAACTCTTCCTTTCATCACTGTGATTGGAGTGGTGTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

6876 bp · LXL04_012319|LXL04_012319|OH1004|CDS

ATGTGTAATGCTACTCACCATTTTCAGCCAGCAACATGCAAGTATCCTTGTACTTGTAAGTTTAGTTCCAAAATGAACTCTCGTGTTGCTATTCTCTTCTCTCTTCTTATCATATCTCTGATTGCCTCCACCATCTCTGCTTCCAATGAGGGTAATGAGACCGATTACCAGGCGTTAATGCAGTTCAAGTCACTGGTCAGAAATGAAGGTCTAAGGTCATGGAACTCTTCCTTTCATCACTGTGATTGGAGTGGTGTTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

2291 aa · LXL04_012319|LXL04_012319|OH1004|PROTEIN

MCNATHHFQPATCKYPCTCKFSSKMNSRVAILFSLLIISLIASTISASNEGNETDYQALMQFKSLVRNEGLRSWNSSFHHCDWSGVSCGKQHRRVTALRLKSQGLEGSLSPHVGNLSFLRYFSLADNNFQGSIPQELGRLSRLRLVNLTFNKFNGVIPSNLSRCSNLEELDLSHNNLVGSIPKEISFLSKLGFFNLSTNILTGGIPLFLGNLTSMKVFSAMENPFGGSIPDTLGNLKSLTQLYLAGCLLSGTIPTNLFGC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_012319
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_012319
位置Chr03:10333438-10345613 (-)
描述Similar to At3g47570: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g47570 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At3g47570。 暂无已核实直接文献
At5g20480 构成了模式识别受体（PPR），决定对延伸因子Tu（EF-Tu）的特异性感知，EF-Tu 是一种强效的病原相关分子模式（PAMPs）防御反应诱导物；在诱导后磷酸化BIK1，以调控免疫反应，例如防御激素的表达（如茉莉酸（JA）和水杨酸（SA））。 暂无已核实直接文献
At3g47110 推测的类受体蛋白激酶 At3g47110。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os11g0569733 受体激酶，可检测稻瘟病菌 X.oryzae pv. oryzae 的蛋白 Ax21 以促进先天免疫。
Cleavage and nuclear localization of the rice XA21 immune receptor.2012 · DOI: 10.1038/ncomms1932
UniProt: Q1MX30 受体激酶，可检测稻瘟病菌 X.oryzae pv. oryzae 的蛋白 Ax21 以促进先天免疫。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012319 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0032541 cortical endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:1990578 perinuclear endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G47570
osa:107276510
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.864
排名 1 · LXL04_012319 · OH-1004
内质网0.089
排名 2 · LXL04_012319 · OH-1004
细胞质0.059
排名 3 · LXL04_012319 · OH-1004
细胞核0.041
排名 4 · LXL04_012319 · OH-1004
溶酶体／液泡0.026
排名 5 · LXL04_012319 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_253-88 aa
PF23598.2LRR_14110-243 aa
PF13855.13LRR_8142-199 aa
PF12799.14LRR_4237-278 aa
PF13855.13LRR_8238-297 aa
PF23598.2LRR_14427-568 aa
PF13855.13LRR_8486-545 aa
PF23598.2LRR_14588-665 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_012319PF08263.18LRRNT_253887.3e-1762.1
LXL04_012319PF23598.2LRR_141102435.6e-67226.7
LXL04_012319PF13855.13LRR_81421996e-69228.4
LXL04_012319PF12799.14LRR_42372787.9e-55182.4
LXL04_012319PF13855.13LRR_82382976e-69228.4
LXL04_012319PF23598.2LRR_144275685.6e-67226.7
LXL04_012319PF13855.13LRR_84865456e-69228.4
LXL04_012319PF23598.2LRR_145886655.6e-67226.7
LXL04_012319PF00069.32Pkinase78910024.9e-79266.2
LXL04_012319PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr7919974.3e-75253.1
LXL04_012319PF08263.18LRRNT_2120512407.3e-1762.1
LXL04_012319PF13855.13LRR_8129413536e-69228.4
LXL04_012319PF12799.14LRR_4129413337.9e-55182.4
LXL04_012319PF23598.2LRR_14132914405.6e-67226.7
LXL04_012319PF13855.13LRR_8143714976e-69228.4
LXL04_012319PF13855.13LRR_8151015706e-69228.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGP4拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g4757039.793%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
C0LGT6拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase EFR41.909%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SD62拟南芥Putative receptor-like protein kinase At3g4711041.771%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q2R2D5水稻Receptor kinase-like protein Xa2144.526%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q1MX30水稻Receptor kinase-like protein Xa2145.316%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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