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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_012228
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 8697650-8702051 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1296 bp · LXL04_012228|LXL04_012228|OH1004|cDNA

ATGGTGTCCCCCCGTGATTGGCCCGAACCCGTTGTTCGAGTGCAGTCCTTATCAGAAAGCGGCAAACTCGTAATTCCCAACAGATACATCAAACCACCACCCGATCGGCCGTTTCTCGACTCATCTCCGTCCGACATAAACATACCAGTGATCGACCTCGCCGGACTTACGAGCGACGATCTCACTCTCCGGGAATCCACGTTGAAACAGATATCAGTAGCGTGCCGTGAGTGGGGGTTCTTCCAGGTGATTAATCACGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1296 bp · LXL04_012228|LXL04_012228|OH1004|CDS

ATGGTGTCCCCCCGTGATTGGCCCGAACCCGTTGTTCGAGTGCAGTCCTTATCAGAAAGCGGCAAACTCGTAATTCCCAACAGATACATCAAACCACCACCCGATCGGCCGTTTCTCGACTCATCTCCGTCCGACATAAACATACCAGTGATCGACCTCGCCGGACTTACGAGCGACGATCTCACTCTCCGGGAATCCACGTTGAAACAGATATCAGTAGCGTGCCGTGAGTGGGGGTTCTTCCAGGTGATTAATCACGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

431 aa · LXL04_012228|LXL04_012228|OH1004|PROTEIN

MVSPRDWPEPVVRVQSLSESGKLVIPNRYIKPPPDRPFLDSSPSDINIPVIDLAGLTSDDLTLRESTLKQISVACREWGFFQVINHGVKPELVDGAREIWREFFHEPMEVKQQYANSPTTYEGYGSRLGLQKGAILDWSDYYFLHYLPPSLKDHSRWPGQPSSLREIIEEYSKEIVRLGRVLLEVFSVDLGLEHDHLQKAFGGEDIGACLRVNFYPKCPQPDLTLGLSSHSDPGGITFLLPDENVSGLQVRRGDQWVTVK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_012228
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_012228
位置Chr03:8697650-8702051 (+)
描述Similar to At3g11180: Probable 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase At3g111800
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g11180 2-氧代戊二酸依赖双加氧酶，参与茉莉酸（JA）的氧化，JA 是一种应激诱导的植物激素，在病原体和草食性动物攻击时合成，通过 JA 介导的信号通路触发防御反应的激活。 暂无已核实直接文献
At5g05600 2-氧代戊二酸依赖性双加氧酶参与茉莉酸 的氧化，茉莉酸是一种应激诱导的植物激素，为响应病原体和食草动物的攻击而合成，通过 JA 介导的信号通路触发防御反应的激活。
Detoxification of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) in Arabidopsis thaliana involves a putative flavonol synthase.2017 · DOI: 10.1016/j.jhazmat.2016.08.058
At3g55970 2-氧代戊二酸依赖双加氧酶，参与茉莉酸（JA）的氧化，JA 是一种应激诱导的植物激素，在病原体和草食性动物攻击时合成，通过 JA 介导的信号通路触发防御反应的激活。 暂无已核实直接文献
At2g38240 2-氧代戊二酸依赖双加氧酶，参与茉莉酸（JA）的氧化，JA 是一种应激诱导的植物激素，在病原体和草食性动物攻击时合成，通过 JA 介导的信号通路触发防御反应的激活。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os10g0536400 催化 2S-黄烷酮 3-β-羟基化生成 2R,3R-二氢黄酮醇，后者是植物中黄酮醇、花青素、儿茶素和原花青素生物合成的中间体。
Flavanone 3beta-hydroxylases from rice: key enzymes for favonol and anthocyanin biosynthesis.2008 · DOI: 10.1016/s1016-8478(23)17587-x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012228 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009813 flavonoid biosynthetic process 生物过程
GO:0097237 cellular response to toxic substance 生物过程
GO:1900150 regulation of defense response to fungus 生物过程
GO:1900366 negative regulation of defense response to insect 生物过程
GO:2000022 regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005506 iron ion binding 分子功能
GO:0016706 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity 分子功能
GO:0031418 L-ascorbic acid binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G38240
ath:AT3G11180
ath:AT3G55970
ath:AT5G05600
dosa:Os10g0536400
osa:4349238
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.707
排名 1 · LXL04_012228 · OH-1004
细胞核0.336
排名 2 · LXL04_012228 · OH-1004
过氧化物酶体0.081
排名 3 · LXL04_012228 · OH-1004
质体0.066
排名 4 · LXL04_012228 · OH-1004
线粒体0.062
排名 5 · LXL04_012228 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14226.13DIOX_N48-158 aa
PF03171.272OG-FeII_Oxy208-306 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_012228PF14226.13DIOX_N481581.9e-30106.6
LXL04_012228PF03171.272OG-FeII_Oxy2083061.9e-33115.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SRM3拟南芥Jasmonate-induced oxygenase 165.230%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FFF6拟南芥Jasmonate-induced oxygenase 264.638%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LY48拟南芥Jasmonate-induced oxygenase 363.324%Swiss-Prot强数据库同源证据
O80449拟南芥Jasmonate-induced oxygenase 457.790%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8W2X5水稻Flavanone 3-dioxygenase 240.683%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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