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基因概览

LXL04_011916

当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 2738179-2742327 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

771 bp · LXL04_011916|LXL04_011916|OH1004|cDNA

ATGGTTAACCACCAATTTTGTTTGCGTGAACAAGCGAGTCTTCGTGGGATTTCGGCAAGCTGTGCGAAGATTCCCAAACGAACAATAACGACAATGTGGAAGGTATTTTCATTCGATTCCAGATATTCCCACGTTTCCATTTATAAAAACTACAGGAACAACCCTTTTTCATCATTATTACAGCCTATTTACATAGATGAAAGACGTGGAAATGAAAAAGTGGTGATAAACTGCTGTTTTGTGAAATATGCAAAAACAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

771 bp · LXL04_011916|LXL04_011916|OH1004|CDS

ATGGTTAACCACCAATTTTGTTTGCGTGAACAAGCGAGTCTTCGTGGGATTTCGGCAAGCTGTGCGAAGATTCCCAAACGAACAATAACGACAATGTGGAAGGTATTTTCATTCGATTCCAGATATTCCCACGTTTCCATTTATAAAAACTACAGGAACAACCCTTTTTCATCATTATTACAGCCTATTTACATAGATGAAAGACGTGGAAATGAAAAAGTGGTGATAAACTGCTGTTTTGTGAAATATGCAAAAACAGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

256 aa · LXL04_011916|LXL04_011916|OH1004|PROTEIN

MVNHQFCLREQASLRGISASCAKIPKRTITTMWKVFSFDSRYSHVSIYKNYRNNPFSSLLQPIYIDERRGNEKVVINCCFVKYAKTEDAAQAIRSLHNQHVFPGELKEPAQLSFQFMGTKWDGVLNNCAIADMDAIGKEAQLRGFEFARSITLVAEPFTMENGLLTPTFKLPSVSSIWLLTEEGLTGVLNRGHFGPDSNKKTGQHKDVNIWGRTGLVPPIKKHKNQKFYTSSSSACVFHAQMKSKSSYSPVSWQPN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_011916`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_011916

位置 Chr03:2738179-2742327 (+)

描述 Similar to LACS6: Long chain acyl-CoA synthetase 6, peroxisomal

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g05970`	活化长链脂肪酸，用于细胞脂质的合成以及通过β-氧化进行降解（可能）。	Two long-chain acyl-CoA synthetases from Arabidopsis thaliana involved in peroxisomal fatty acid beta-oxidation.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01405.x Molecular characterization of an Arabidopsis acyl-coenzyme a synthetase localized on glyoxysomal membranes.2002 · DOI: 10.1104/pp.012955 Peroxisomal Acyl-CoA synthetase activity is essential for seedling development in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019646 Analysis of the role of COMATOSE and peroxisomal beta-oxidation in the determination of germination potential in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1093/jxb/erl045
`At5g27600`	活化长链脂肪酸，用于细胞脂质的合成以及通过β-氧化进行降解（可能）。	Two long-chain acyl-CoA synthetases from Arabidopsis thaliana involved in peroxisomal fatty acid beta-oxidation.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2002.01405.x Peroxisomal Acyl-CoA synthetase activity is essential for seedling development in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019646 Analysis of the role of COMATOSE and peroxisomal beta-oxidation in the determination of germination potential in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1093/jxb/erl045

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011916 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0001676 long-chain fatty acid metabolic process 生物过程

GO:0006631 fatty acid metabolic process 生物过程

GO:0008654 phospholipid biosynthetic process 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0010193 response to ozone 生物过程

GO:0010747 positive regulation of long-chain fatty acid import across plasma membrane 生物过程

GO:0010867 positive regulation of triglyceride biosynthetic process 生物过程

GO:0015908 fatty acid transport 生物过程

GO:0016114 terpenoid biosynthetic process 生物过程

GO:0032000 positive regulation of fatty acid beta-oxidation 生物过程

GO:0035338 long-chain fatty-acyl-CoA biosynthetic process 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G05970

ath:AT5G27600

hsa:51703

mmu:433256

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.565

排名 1 · LXL04_011916 · OH-1004

细胞质0.185

排名 2 · LXL04_011916 · OH-1004

细胞核0.113

排名 3 · LXL04_011916 · OH-1004

质体0.088

排名 4 · LXL04_011916 · OH-1004

过氧化物酶体0.057

排名 5 · LXL04_011916 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8LPS1`	拟南芥	Long chain acyl-CoA synthetase 6, peroxisomal	70.455%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q8LKS5`	拟南芥	Long chain acyl-CoA synthetase 7, peroxisomal	64.000%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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