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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_010858
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 154436611-154438572 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1797 bp · LXL04_010858|LXL04_010858|OH1004|cDNA

ATGCGGATCATCTCCTCCAAATTTATCTTTCGCGCCCACACTCTGAccatgatgatgatgatgatgatgcttCCTTTTATGTTAGCAACCTCATGTCCTACTGATATCCAAAGGCCAAATATGTGTAAGATTGGATTCTGTTGCGACAATGGAAGTGTAGTTAGGCTAACCATTAATACTTGTGATGGAAGTGACCTGAAAAATGTAAACTTTTCTTCATTCCCGGGCCTTGAGAGACTGTTTATTGAAAAAAGTCATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1797 bp · LXL04_010858|LXL04_010858|OH1004|CDS

ATGCGGATCATCTCCTCCAAATTTATCTTTCGCGCCCACACTCTGACCATGATGATGATGATGATGATGCTTCCTTTTATGTTAGCAACCTCATGTCCTACTGATATCCAAAGGCCAAATATGTGTAAGATTGGATTCTGTTGCGACAATGGAAGTGTAGTTAGGCTAACCATTAATACTTGTGATGGAAGTGACCTGAAAAATGTAAACTTTTCTTCATTCCCGGGCCTTGAGAGACTGTTTATTGAAAAAAGTCATAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

598 aa · LXL04_010858|LXL04_010858|OH1004|PROTEIN

MRIISSKFIFRAHTLTMMMMMMMLPFMLATSCPTDIQRPNMCKIGFCCDNGSVVRLTINTCDGSDLKNVNFSSFPGLERLFIEKSHIEGNILHQIGLLHNLIDIYLWQNYVKGTFPVSFTNLTRLKYLYLSENNFNGTFPVLFNNLIRLKHLDLCRNNFNSKFFVSFTNLTRLEQLYISHNAFSGTFPLSFVNLTQLQYVNISQNSGTPPASFIGLTKLQHLYLSCNNFSSTFPLSFTNLTRLEYLDLSRNNFSGTFPLS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_010858
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_010858
位置Chr02:154436611-154438572 (-)
描述Similar to GSO2: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g44700 与 GSO1 一起，是在胚胎和子叶表皮表面发育过程中所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At5g48940 与RGI1、RGI3、RGI4和RGI5一起，作为RGF肽（例如 RGF1、GLV5/CLEL1/RGF2、GLV7/CLEL3/RGF3、GLV3/RGF4、GLV10/CLEL7/RGF5 和 RGF10/CLELN）的受体，这些肽激素通过调控转录因子PLETHORA（PLT，例如PLT1和PLT2）的表达水平和模式，维持胚后根干细胞利基。
RGF1 INSENSITIVE 1 to 5, a group of LRR receptor-like kinases, are essential for the perception of root meristem growth factor 1 in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1038/cr.2016.63
At4g20140 与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸／苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0618700 构成模式识别受体（PPR），决定对鞭毛蛋白（flg22）的特异性识别，flg22是引发对病原相关分子模式（PAMPs）防御反应的有效诱导因子。
Analysis of flagellin perception mediated by flg22 receptor OsFLS2 in rice.2008 · DOI: 10.1094/mpmi-21-12-1635
Rice OsFLS2-Mediated Perception of Bacterial Flagellins Is Evaded by Xanthomonas oryzae pvs. oryzae and oryzicola.2015 · DOI: 10.1016/j.molp.2015.01.012
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010858 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0090708 specification of plant organ axis polarity 生物过程
GO:0160073 Casparian strip assembly 生物过程
GO:2000067 regulation of root morphogenesis 生物过程
GO:2000280 regulation of root development 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0048226 Casparian strip 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G44700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.755
排名 1 · LXL04_010858 · OH-1004
内质网0.094
排名 2 · LXL04_010858 · OH-1004
细胞质0.086
排名 3 · LXL04_010858 · OH-1004
溶酶体／液泡0.059
排名 4 · LXL04_010858 · OH-1004
细胞外0.052
排名 5 · LXL04_010858 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598.2LRR_1482-233 aa
PF13855.13LRR_8100-159 aa
PF13855.13LRR_8124-182 aa
PF13855.13LRR_8148-205 aa
PF13855.13LRR_8209-253 aa
PF12799.14LRR_4217-257 aa
PF23598.2LRR_14238-320 aa
PF13855.13LRR_8242-301 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_010858PF23598.2LRR_14822331.5e-32113.5
LXL04_010858PF13855.13LRR_81001591e-51173.3
LXL04_010858PF13855.13LRR_81241821e-51173.3
LXL04_010858PF13855.13LRR_81482051e-51173.3
LXL04_010858PF13855.13LRR_82092531e-51173.3
LXL04_010858PF12799.14LRR_42172572.6e-42142.6
LXL04_010858PF23598.2LRR_142383201.5e-32113.5
LXL04_010858PF13855.13LRR_82423011e-51173.3
LXL04_010858PF12799.14LRR_42653032.6e-42142.6
LXL04_010858PF12799.14LRR_42893292.6e-42142.6
LXL04_010858PF13855.13LRR_83083491e-51173.3
LXL04_010858PF12799.14LRR_43133512.6e-42142.6
LXL04_010858PF23598.2LRR_143333931.5e-32113.5
LXL04_010858PF12799.14LRR_43613992.6e-42142.6
LXL04_010858PF13855.13LRR_83624211e-51173.3
LXL04_010858PF23598.2LRR_143824891.5e-32113.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FIZ3拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO233.138%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGV1拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RGI234.172%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGQ5拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO131.660%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q0JA29水稻LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FLS234.452%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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