LXL04_010151 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_010151

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 141082258-141083410 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

567 bp · LXL04_010151|LXL04_010151|OH1004|cDNA

GTTATCGGACACTCGGACATCCAAAACACCCAAAGGCAGACTTCACCGAAATCTACGACAGCCCAACCCCAGGCATCTTTTCTCTGGAGACAAATGGCGAGCTCTCTCCGTCGCATCGGAAGCCAATCTAGCACCGCTCATCGGTTTGTTGTTCCTCAGTTAATCAGTCGATTCTCTACAGATGCCTTATCTGTTGAGTATAAAGCTGGAGAGATCGGCACTGTTTCGGGTATTCCGGATGAACATCTTCAAAGGAGGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

474 bp · LXL04_010151|LXL04_010151|OH1004|CDS

ATGGCGAGCTCTCTCCGTCGCATCGGAAGCCAATCTAGCACCGCTCATCGGTTTGTTGTTCCTCAGTTAATCAGTCGATTCTCTACAGATGCCTTATCTGTTGAGTATAAAGCTGGAGAGATCGGCACTGTTTCGGGTATTCCGGATGAACATCTTCAAAGGAGGGTTCTGATCTATTCACCAGCTCGAACAGCATCACAGCAAGGAGCAGGAAAAGTTGGAAAGTGGAAAATCAATTTTATGTCAACACAGAAATGGGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

157 aa · LXL04_010151|LXL04_010151|OH1004|PROTEIN

MASSLRRIGSQSSTAHRFVVPQLISRFSTDALSVEYKAGEIGTVSGIPDEHLQRRVLIYSPARTASQQGAGKVGKWKINFMSTQKWENPLMGWTSTGDPYANVGDSALTFKTEADAKSFAERHGWNYTVKKHQTPLMKAKAYSDNFKWKGPPKTAEN

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_010151`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_010151

位置 Chr02:141082258-141083410 (+)

描述 Similar to FRO1: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g67590`	线粒体膜呼吸链NADH脱氢酶（复合体 I）的辅助亚基，据信不参与催化。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010151 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0001932 regulation of protein phosphorylation 生物过程

GO:0006120 mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone 生物过程

GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程

GO:0009060 aerobic respiration 生物过程

GO:0009631 cold acclimation 生物过程

GO:0022904 respiratory electron transport chain 生物过程

GO:0032981 mitochondrial respiratory chain complex I assembly 生物过程

GO:0042776 proton motive force-driven mitochondrial ATP synthesis 生物过程

GO:0051591 response to cAMP 生物过程

GO:0072593 reactive oxygen species metabolic process 生物过程

GO:1902600 proton transmembrane transport 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G67590

ggo:101125075

hsa:4724

pon:100172316

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.943

排名 1 · LXL04_010151 · OH-1004

细胞质0.048

排名 2 · LXL04_010151 · OH-1004

细胞核0.046

排名 3 · LXL04_010151 · OH-1004

质体0.022

排名 4 · LXL04_010151 · OH-1004

细胞膜0.016

排名 5 · LXL04_010151 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04800.18NDUS456-149 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_010151	`PF04800.18`	NDUS4	56	149	5.4e-31	107.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FJW4`	拟南芥	NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial	64.935%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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