基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_010120
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 140615268-140630067
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4242 bp · LXL04_010120|LXL04_010120|OH1004|cDNA
ATGAAGAAGATGGGATTTACTAACAAGTGGGTGGCCTGGATTAAAGCAGCATTGTCTTCTTCGTGGGCTTCTGTTTTGTTAAATGGGGCGCCAACGGAGGAGTTTCGTTTACAGCGCGGTCTCAGACAGGGTGATCCTTTGTCGCCATTTCTTTTTGTATTAGCGATGGAGGGGTTTCATATCGCTCTTGAGGAGGTTGCTAAAGCCGGGGTGTTTCGTGGGGTTTCGATTGGGTGCGTCGGTCTTCATGTGTCTCATTT...
CDS
下载 CDS FASTA4242 bp · LXL04_010120|LXL04_010120|OH1004|CDS
ATGAAGAAGATGGGATTTACTAACAAGTGGGTGGCCTGGATTAAAGCAGCATTGTCTTCTTCGTGGGCTTCTGTTTTGTTAAATGGGGCGCCAACGGAGGAGTTTCGTTTACAGCGCGGTCTCAGACAGGGTGATCCTTTGTCGCCATTTCTTTTTGTATTAGCGATGGAGGGGTTTCATATCGCTCTTGAGGAGGTTGCTAAAGCCGGGGTGTTTCGTGGGGTTTCGATTGGGTGCGTCGGTCTTCATGTGTCTCATTT...
1413 aa · LXL04_010120|LXL04_010120|OH1004|PROTEIN
MKKMGFTNKWVAWIKAALSSSWASVLLNGAPTEEFRLQRGLRQGDPLSPFLFVLAMEGFHIALEEVAKAGVFRGVSIGCVGLHVSHFLYADDVVLLCDWGVENARRIIRIMRVFHLASGLKINLLKSKLIGVGVDYEEVQEVADLIGCSATRIPFVYLGVPIGGNMNRVDAWKPMVDRFVAKMSVWEAKLLSIGGRLTLIKAVLGSLAIYYMSIYKVPDMVLKMLEALRARFFWGADMGERKLQWIAWSKILPSKEAGGL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_010120 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_010120 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:140615268-140630067 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ENT3: Equilibrative nucleotide transporter 3 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0015858 nucleoside transport 生物过程 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0005337 nucleoside transmembrane transporter activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G05110 ath:AT4G05120 ath:AT4G05140 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.533
内质网0.182
溶酶体／液泡0.178
细胞质0.085
高尔基体0.079
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00078.33RVT_16-160 aaPF13966.12zf-RVT418-482 aaPF01733.25Nucleoside_tran697-776 aaPF01733.25Nucleoside_tran809-956 aaPF01733.25Nucleoside_tran1100-1391 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_010120 | PF00078.33 | RVT_1 | 6 | 160 | 1e-12 | 49.1 |
| LXL04_010120 | PF13966.12 | zf-RVT | 418 | 482 | 1.6e-11 | 45.4 |
| LXL04_010120 | PF01733.25 | Nucleoside_tran | 697 | 776 | 8.4e-57 | 193.6 |
| LXL04_010120 | PF01733.25 | Nucleoside_tran | 809 | 956 | 8.4e-57 | 193.6 |
| LXL04_010120 | PF01733.25 | Nucleoside_tran | 1100 | 1391 | 8.4e-57 | 193.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9M0Y3 | 拟南芥 | Equilibrative nucleotide transporter 3 | 64.439% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9M0Y1 | 拟南芥 | Equilibrative nucleotide transporter 5 | 62.830% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q944N8 | 拟南芥 | Equilibrative nucleotide transporter 6 | 61.871% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9M0Y2 | 拟南芥 | Equilibrative nucleotide transporter 4 | 59.666% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q944P0 | 拟南芥 | Equilibrative nucleotide transporter 7 | 56.010% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |