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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_010074
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 139375227-139386950 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2127 bp · LXL04_010074|LXL04_010074|OH1004|cDNA

ATGGAGGCTTTCGACCATCTCAGATTTCCACTAAAGATTATACTGCATGCGACCAAGAACTTTGGTGCTGAAAACTTCATAGCCGAGGGTGGATTCGGGAAGGTTTATAGAGGGGAATTCTCAAACACCATGGGTGCACTGTTTAATCGATTAATAGACAAAGCAGATGTTTCATTTCGGACTGAAATCATGTTTCTTACAAGTTGTTCACATGAAAATCTCATCTCACTCATGGGATTCTGTGATGAGGGTGAGAATAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2127 bp · LXL04_010074|LXL04_010074|OH1004|CDS

ATGGAGGCTTTCGACCATCTCAGATTTCCACTAAAGATTATACTGCATGCGACCAAGAACTTTGGTGCTGAAAACTTCATAGCCGAGGGTGGATTCGGGAAGGTTTATAGAGGGGAATTCTCAAACACCATGGGTGCACTGTTTAATCGATTAATAGACAAAGCAGATGTTTCATTTCGGACTGAAATCATGTTTCTTACAAGTTGTTCACATGAAAATCTCATCTCACTCATGGGATTCTGTGATGAGGGTGAGAATAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

708 aa · LXL04_010074|LXL04_010074|OH1004|PROTEIN

MEAFDHLRFPLKIILHATKNFGAENFIAEGGFGKVYRGEFSNTMGALFNRLIDKADVSFRTEIMFLTSCSHENLISLMGFCDEGENRILVYEYADFGLSRHGPANQDRTFVFSEAKGTLGYCDPMYVEDMLLTKESDVYSFGVVLFEALCSRPCVEWKYTKYWSRSTTMKKDHYPTCRPKMESVVSKLKTALEFQEIFDVKIAEIGHRMSLNEIVFDFKPYKKTDVDHFRIPLEKIMDATKNFSAENFIAESRYGKVYRG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_010074
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_010074
位置Chr02:139375227-139386950 (+)
描述Similar to HERK1: Receptor-like protein kinase HERK 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g59700 可能的受体样蛋白激酶 At5g59700。 暂无已核实直接文献
At4g39110 可能的受体样蛋白激酶 At4g39110。 暂无已核实直接文献
At1g30570 可能的受体样蛋白激酶 At1g30570。 暂无已核实直接文献
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位，参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
FERONIA receptor-like kinase regulates RHO GTPase signaling of root hair development.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005366107

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010074 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0043680 filiform apparatus 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G46290
ath:AT5G59700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.654
排名 1 · LXL04_010074 · OH-1004
细胞核0.336
排名 2 · LXL04_010074 · OH-1004
细胞膜0.165
排名 3 · LXL04_010074 · OH-1004
内质网0.051
排名 4 · LXL04_010074 · OH-1004
线粒体0.043
排名 5 · LXL04_010074 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr26-94 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr94-185 aa
PF00069.32Pkinase94-159 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr247-510 aa
PF00069.32Pkinase252-507 aa
PF00462.31Glutaredoxin564-628 aa
PF23733.3GRXCR1-2_C659-701 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_010074PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr26947.3e-40137.6
LXL04_010074PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr941857.3e-40137.6
LXL04_010074PF00069.32Pkinase941594.9e-33115.4
LXL04_010074PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr2475107.3e-40137.6
LXL04_010074PF00069.32Pkinase2525074.9e-33115.4
LXL04_010074PF00462.31Glutaredoxin5646281.9e-1041.5
LXL04_010074PF23733.3GRXCR1-2_C6597016.8e-0936.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LX66拟南芥Receptor-like protein kinase HERK 139.423%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FN92拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g5970040.468%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9T020拟南芥Probable receptor-like protein kinase At4g3911036.950%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SA72拟南芥Probable receptor-like protein kinase At1g3057037.855%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SCZ4拟南芥Receptor-like protein kinase FERONIA38.562%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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