基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_009954
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 136702807-136704590
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1629 bp · LXL04_009954|LXL04_009954|OH1004|cDNA
ATGGCCTCAAAAACTCGTGCTATGCCACCATCTTTGGATCAAATCACCACAAAGCATGTCCTAGGAAATGATTTGGAAGCTAAACTAGCTTCCAAGCTATTAATTACTCCCCCAGAAACTCCTAAGGTCCCAGATGTTTCCATTGATCATGAAAAGAAAGCAGCTGAGAAAGGAAGTGTGAAGAACAGCTCGGTTTCAGATAAAACAAGTGATGGAACCAGCAGTCTGGGGAAAACAAGTGGGAGTGCACTTGTGGAGAG...
CDS
下载 CDS FASTA1629 bp · LXL04_009954|LXL04_009954|OH1004|CDS
ATGGCCTCAAAAACTCGTGCTATGCCACCATCTTTGGATCAAATCACCACAAAGCATGTCCTAGGAAATGATTTGGAAGCTAAACTAGCTTCCAAGCTATTAATTACTCCCCCAGAAACTCCTAAGGTCCCAGATGTTTCCATTGATCATGAAAAGAAAGCAGCTGAGAAAGGAAGTGTGAAGAACAGCTCGGTTTCAGATAAAACAAGTGATGGAACCAGCAGTCTGGGGAAAACAAGTGGGAGTGCACTTGTGGAGAG...
542 aa · LXL04_009954|LXL04_009954|OH1004|PROTEIN
MASKTRAMPPSLDQITTKHVLGNDLEAKLASKLLITPPETPKVPDVSIDHEKKAAEKGSVKNSSVSDKTSDGTSSLGKTSGSALVESGKSSMCRGSTSSNVSDESSCSSFSSSINKPHKSNDSRWEAIQVVRARDGALGLTHFRLLKRLGCGDIGSVYLAELTGTKAYFAMKVMDKASLASRKKLLRAQTEREILQSLDHPFLPSLYTHFETDKFSCLVMEFCPGGDLHTLRQRQPGKHFTEQAVKFYVAEVLLAMEYLH...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_009954 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_009954 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:136702807-136704590 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to D6PKL2: Serine/threonine-protein kinase D6PKL2 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程 GO:0009630 gravitropism 生物过程 GO:0009638 phototropism 生物过程 GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程 GO:0010540 basipetal auxin transport 生物过程 GO:0048766 root hair initiation 生物过程 GO:2000114 regulation of establishment of cell polarity 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005730 nucleolus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009925 basal plasma membrane 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G26610 ath:AT5G47750 ath:AT5G55910 dosa:Os06g0291600 osa:4340792 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.616
细胞核0.350
细胞膜0.140
线粒体0.056
高尔基体0.048
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00069.32Pkinase144-295 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr144-295 aaPF00069.32Pkinase379-482 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr386-470 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_009954 | PF00069.32 | Pkinase | 144 | 295 | 8.3e-60 | 203.1 |
| LXL04_009954 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 144 | 295 | 1.2e-29 | 104.2 |
| LXL04_009954 | PF00069.32 | Pkinase | 379 | 482 | 8.3e-60 | 203.1 |
| LXL04_009954 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 386 | 470 | 1.2e-29 | 104.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q39183 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase D6PKL2 | 80.747% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9FG74 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase D6PK | 73.084% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9SUA3 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase D6PKL1 | 74.174% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q0DCT8 | 水稻 | Protein kinase G11A | 74.951% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
A2YBX5 | 水稻 | Protein kinase G11A | 74.951% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |