LXL04_009179 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_009179

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 119647756-119650628 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2298 bp · LXL04_009179|LXL04_009179|OH1004|cDNA

ATGAGTTCGGTGTTGCTATCAGATCTGGCAACGGAAATTATTATTCCGGTATGTGCTGTGATTGGTATCGTTTTTTCTCTGATCCAATGGGCGTTGGTGTCAAGAGTAAAGCTCACTCCGGACCGTAACGGTTCCCCGGCAAACAGCAACAAGAATGGGTACAATGATTCCTTAATCGAAGAAGAGGAGGGCGTTAACGAACATAACGTCGTCGCAAAATGCGCTGAGATTCAGAATGCCATCTCTGAAGGAGCAACATC...

CDS

下载 CDS FASTA

2298 bp · LXL04_009179|LXL04_009179|OH1004|CDS

ATGAGTTCGGTGTTGCTATCAGATCTGGCAACGGAAATTATTATTCCGGTATGTGCTGTGATTGGTATCGTTTTTTCTCTGATCCAATGGGCGTTGGTGTCAAGAGTAAAGCTCACTCCGGACCGTAACGGTTCCCCGGCAAACAGCAACAAGAATGGGTACAATGATTCCTTAATCGAAGAAGAGGAGGGCGTTAACGAACATAACGTCGTCGCAAAATGCGCTGAGATTCAGAATGCCATCTCTGAAGGAGCAACATC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

765 aa · LXL04_009179|LXL04_009179|OH1004|PROTEIN

MSSVLLSDLATEIIIPVCAVIGIVFSLIQWALVSRVKLTPDRNGSPANSNKNGYNDSLIEEEEGVNEHNVVAKCAEIQNAISEGATSFLLTEYQYVGIFMVVFAILIFLFLGSVEGFSTKSKQCTYNIHSMCKPAIATALFSTIAFVLGAITSVLSGFLGMKIATYANARTTLEARKGVGKAFITAFRSGAVMGFLLAANGLLVLYITINLFKLYYGDDWEGLFEAITGYGLGGSSMALFGRVGGGIYTKAADVGADLVG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_009179`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_009179

位置 Chr02:119647756-119650628 (+)

描述 Similar to Pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g15690`	可能参与建立从细胞质到液泡腔的跨液泡膜 H⁺ 电化学势差。	Arabidopsis H+-PPase AVP1 regulates auxin-mediated organ development.2005 · DOI: 10.1126/science.1115711

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009179 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005985 sucrose metabolic process 生物过程

GO:0006814 sodium ion transport 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0009926 auxin polar transport 生物过程

GO:0010248 establishment or maintenance of transmembrane electrochemical gradient 生物过程

GO:0010581 regulation of starch biosynthetic process 生物过程

GO:0048366 leaf development 生物过程

GO:0052546 cell wall pectin metabolic process 生物过程

GO:0055085 transmembrane transport 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G15690

lic:LIC_12285

lil:LA_1471

vra:106768298

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.383

排名 1 · LXL04_009179 · OH-1004

细胞膜0.231

排名 2 · LXL04_009179 · OH-1004

内质网0.220

排名 3 · LXL04_009179 · OH-1004

细胞质0.151

排名 4 · LXL04_009179 · OH-1004

高尔基体0.120

排名 5 · LXL04_009179 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03030.22H_PPase59-751 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_009179	`PF03030.22`	H_PPase	59	751	8.6e-257	854.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P31414`	拟南芥	Pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump 1	89.122%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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