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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_008926
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 112643797-112646805 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2568 bp · LXL04_008926|LXL04_008926|OH1004|cDNA

ATGGAGGCTATGCTCAAGGTATTATTTTATCTCTTTTTCATCTTGCTGTTGCTGGTTAACTCGGTGTTGACCCAGTCCACGGTGCGGCCACTGAGTTCCGGTGTGGAAAGAACAGCGCTGTTCGATCTTCGAGCTTCTTTAGGAATAAAAGCCAGATACTGGCCGAGGAAAGTAGACCCGTGTGCCAACTGGACAGGGGTGGAGTGCGGGAACGGCCGAGTCACCGGAATAAATTTGTCCGGTTTACGACGAACTCGTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2568 bp · LXL04_008926|LXL04_008926|OH1004|CDS

ATGGAGGCTATGCTCAAGGTATTATTTTATCTCTTTTTCATCTTGCTGTTGCTGGTTAACTCGGTGTTGACCCAGTCCACGGTGCGGCCACTGAGTTCCGGTGTGGAAAGAACAGCGCTGTTCGATCTTCGAGCTTCTTTAGGAATAAAAGCCAGATACTGGCCGAGGAAAGTAGACCCGTGTGCCAACTGGACAGGGGTGGAGTGCGGGAACGGCCGAGTCACCGGAATAAATTTGTCCGGTTTACGACGAACTCGTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

855 aa · LXL04_008926|LXL04_008926|OH1004|PROTEIN

MEAMLKVLFYLFFILLLLVNSVLTQSTVRPLSSGVERTALFDLRASLGIKARYWPRKVDPCANWTGVECGNGRVTGINLSGLRRTRVGSLSPSFSIDSLVRCTQLSTFNASGFALPGRIPDWLGQNLRALQVLDLTSSSIVGPIPPSIGSLNQLTLLLLADNSLTGNIPDSLRQLSSLSVLNLSLNMLTGSIPSSFSSLTNLTTLDFSSNFLSGPIPPTFGSFSGLQFLNLSNNSLASSIPVQLGNLSQLLDLDLGFNSF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_008926
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_008926
位置Chr02:112643797-112646805 (+)
描述Similar to At2g16250: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g16250
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g16250 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g16250。 暂无已核实直接文献
At1g55610 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的受体。
BRL1, a leucine-rich repeat receptor-like protein kinase, is functionally redundant with BRI1 in regulating Arabidopsis brassinosteroid signaling.2004 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02214.x
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403
At3g13380 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403
At4g20140 与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸／苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0130100 参与盐碱干旱应激反应的受体激酶。
Receptor-like kinase OsSIK1 improves drought and salt stress tolerance in rice (Oryza sativa) plants.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04146.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008926 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005496 steroid binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G55610
ath:AT2G16250
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.817
排名 1 · LXL04_008926 · OH-1004
内质网0.083
排名 2 · LXL04_008926 · OH-1004
细胞质0.069
排名 3 · LXL04_008926 · OH-1004
细胞核0.056
排名 4 · LXL04_008926 · OH-1004
溶酶体／液泡0.038
排名 5 · LXL04_008926 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598.2LRR_14120-183 aa
PF13855.13LRR_8129-188 aa
PF13855.13LRR_8153-210 aa
PF13855.13LRR_8177-236 aa
PF23598.2LRR_14190-292 aa
PF13855.13LRR_8225-284 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr493-765 aa
PF00069.32Pkinase495-763 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_008926PF23598.2LRR_141201836.2e-1762.1
LXL04_008926PF13855.13LRR_81291885.6e-1349.1
LXL04_008926PF13855.13LRR_81532105.6e-1349.1
LXL04_008926PF13855.13LRR_81772365.6e-1349.1
LXL04_008926PF23598.2LRR_141902926.2e-1762.1
LXL04_008926PF13855.13LRR_82252845.6e-1349.1
LXL04_008926PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr4937655.6e-2175.7
LXL04_008926PF00069.32Pkinase4957635.4e-1452.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGK4拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1625049.634%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9ZWC8拟南芥Serine/threonine-protein kinase BRI1-like 129.801%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LJF3拟南芥Receptor-like protein kinase BRI1-like 330.251%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGQ5拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO130.223%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q658G7水稻LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase SIK130.688%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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