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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_008718
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 106858546-106859725 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

900 bp · LXL04_008718|LXL04_008718|OH1004|cDNA

ATGGATTCTTGGAGCTTTGACTCTAAAACAAATATGGGGTCTATGGATTGGGAAGCCAAGTCCCCATTTATCTTTGAGAACAATATGGTTTGTTCCCATGATGCAATAAGCATTAACCAAGGATTTGAGGATACCTGTGTTCCTGATCAAATCCTCGGGAGTTTTTCGTTGAGTCCGATTATGGGTGGCACTCATAACAAATTTCTTGAAGAACATGCACCGAGTTCTGAGTTATCGGGTTCTTCTTTCAAGTCAAGTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

900 bp · LXL04_008718|LXL04_008718|OH1004|CDS

ATGGATTCTTGGAGCTTTGACTCTAAAACAAATATGGGGTCTATGGATTGGGAAGCCAAGTCCCCATTTATCTTTGAGAACAATATGGTTTGTTCCCATGATGCAATAAGCATTAACCAAGGATTTGAGGATACCTGTGTTCCTGATCAAATCCTCGGGAGTTTTTCGTTGAGTCCGATTATGGGTGGCACTCATAACAAATTTCTTGAAGAACATGCACCGAGTTCTGAGTTATCGGGTTCTTCTTTCAAGTCAAGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

299 aa · LXL04_008718|LXL04_008718|OH1004|PROTEIN

MDSWSFDSKTNMGSMDWEAKSPFIFENNMVCSHDAISINQGFEDTCVPDQILGSFSLSPIMGGTHNKFLEEHAPSSELSGSSFKSSGLFDIIPHAPSKQKRISSPPLCKVHGCNKSLVSCKDYHKRHKVCELHSKTSKVIVNGIEQRFCQQCSRFHLLSEFDEGKRSCRKRLADHNERRRKPHSGHHERLLPPYNPKGSKFKGFTRTRGAKSSSMCNDDIGTMSSVTDVHQYPWIYGHNNGYLQPSNSVLFPHASECLTG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_008718
TK1151 IDTkA03G342400
OH-1004 IDLXL04_008718
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_008718
位置Chr02:106858546-106859725 (-)
描述Similar to SPL6: Squamosa promoter-binding-like protein 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g69170 与共有核苷酸序列 5'-TNCGTACAA-3' 特异性结合的反式作用因子。 暂无已核实直接文献
At1g02065 与共有核苷酸序列 5'-TNCGTACAA-3' 特异性结合的反式作用因子。
SPL8, an SBP-box gene that affects pollen sac development in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1105/tpc.010678
Functional dissection of the plant-specific SBP-domain: overlap of the DNA-binding and nuclear localization domains.2005 · DOI: 10.1016/j.jmb.2005.07.013
SPL8, a local regulator in a subset of gibberellin-mediated developmental processes in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1007/s11103-006-9099-6
At5g43270 与共有核苷酸序列 5'-TNCGTACAA-3' 特异性结合的反式作用因子。 暂无已核实直接文献
At5g50670 与共有核苷酸序列 5'-TNCGTACAA-3' 特异性结合的反式作用因子。 暂无已核实直接文献
At5g50570 与共有核苷酸序列 5'-TNCGTACAA-3' 特异性结合的反式作用因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008718 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009554 megasporogenesis 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0048510 regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase 生物过程
GO:0048653 anther development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G02065
ath:AT1G69170
ath:AT5G43270
ath:AT5G50570
ath:AT5G50670
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.918
排名 1 · LXL04_008718 · OH-1004
细胞质0.169
排名 2 · LXL04_008718 · OH-1004
细胞膜0.032
排名 3 · LXL04_008718 · OH-1004
内质网0.018
排名 4 · LXL04_008718 · OH-1004
质体0.013
排名 5 · LXL04_008718 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03110.20SBP108-181 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_008718PF03110.20SBP1081814.7e-31107.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94JW8拟南芥Squamosa promoter-binding-like protein 674.725%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q8GXL3拟南芥Squamosa promoter-binding-like protein 871.250%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9S840拟南芥Squamosa promoter-binding-like protein 268.750%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
P0DI11拟南芥Squamosa promoter-binding-like protein 13B44.872%Swiss-Prot中等数据库同源证据
B9DI20拟南芥Squamosa promoter-binding-like protein 13A44.872%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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