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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_007580
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 52973585-52977115 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3444 bp · LXL04_007580|LXL04_007580|OH1004|cDNA

ATGATGAAAGCTCATAGCTTTAACAAATTTGCTTTTGTTCTTATCTTGTTTCTCTCTCTAGTGTCTGTTCATGGTGACGTCGATGAATCTCACCAGCTCTTATCGTTTAAATCTTCTCTTAAAAAGCCAAATATATTGACAGATTGGTTGGCTGGGATCCACCCGTGTAATTTTAGTGGTGTTTTTTGTAAAGACTCTAAAGTTTCGTCTATAGATCTCAGTGGTAATGATTTGAGCTCCGATTTCCGTTCGAGATCTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

3444 bp · LXL04_007580|LXL04_007580|OH1004|CDS

ATGATGAAAGCTCATAGCTTTAACAAATTTGCTTTTGTTCTTATCTTGTTTCTCTCTCTAGTGTCTGTTCATGGTGACGTCGATGAATCTCACCAGCTCTTATCGTTTAAATCTTCTCTTAAAAAGCCAAATATATTGACAGATTGGTTGGCTGGGATCCACCCGTGTAATTTTAGTGGTGTTTTTTGTAAAGACTCTAAAGTTTCGTCTATAGATCTCAGTGGTAATGATTTGAGCTCCGATTTCCGTTCGAGATCTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1147 aa · LXL04_007580|LXL04_007580|OH1004|PROTEIN

MMKAHSFNKFAFVLILFLSLVSVHGDVDESHQLLSFKSSLKKPNILTDWLAGIHPCNFSGVFCKDSKVSSIDLSGNDLSSDFRSRSQCSRALVVVDLAENGVSGSFHDASTFTACPKLNTLNLSRNSIDFNGGLKPIGISVEVIDLSYNRISWGKPNVVQWILSNGCRELRHLSVKGNKIAGDLPEFDCPNLEYIDLSANNFSSGFPSFHDCSSLEYLDLSSNKFSGDISGALASCKRLSFLNLTQNQFAGEIPSFPVDS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_007580
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_007580
位置Chr02:52973585-52977115 (+)
描述Similar to Systemin receptor SR160
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g39400 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
Brassinosteroid-insensitive dwarf mutants of Arabidopsis accumulate brassinosteroids.1999 · DOI: 10.1104/pp.121.3.743
Brassinosteroid-insensitive-1 is a ubiquitously expressed leucine-rich repeat receptor serine/threonine kinase.2000 · DOI: 10.1104/pp.123.4.1247
The Arabidopsis transthyretin-like protein is a potential substrate of BRASSINOSTEROID-INSENSITIVE 1.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.023903
The Arabidopsis thaliana brassinosteroid receptor (AtBRI1) contains a domain that functions as a guanylyl cyclase in vitro.2007 · DOI: 10.1371/journal.pone.0000449
BSKs mediate signal transduction from the receptor kinase BRI1 in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1126/science.1156973
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
BSKs are partially redundant positive regulators of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12175
At3g13380 受体具有双重特异性激酶活性，作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
BRL1 and BRL3 are novel brassinosteroid receptors that function in vascular differentiation in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1242/dev.01403

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0718300 参与油菜素甾醇（BR）信号转导的受体激酶。
Loss of function of a rice brassinosteroid insensitive1 homolog prevents internode elongation and bending of the lamina joint.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.9.1591
The role of OsBRI1 and its homologous genes, OsBRL1 and OsBRL3, in rice.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.072330
OsBRI1 Activates BR Signaling by Preventing Binding between the TPR and Kinase Domains of OsBSK3 via Phosphorylation.2016 · DOI: 10.1104/pp.15.01668
OsREM4.1 Interacts with OsSERK1 to Coordinate the Interlinking between Abscisic Acid and Brassinosteroid Signaling in Rice.2016 · DOI: 10.1016/j.devcel.2016.06.011
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007580 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001578 microtubule bundle formation 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009647 skotomorphogenesis 生物过程
GO:0009729 detection of brassinosteroid stimulus 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010224 response to UV-B 生物过程
GO:0010268 brassinosteroid homeostasis 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G13380
ath:AT4G39400
dosa:Os01g0718300
sly:101261320
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.870
排名 1 · LXL04_007580 · OH-1004
内质网0.089
排名 2 · LXL04_007580 · OH-1004
细胞质0.061
排名 3 · LXL04_007580 · OH-1004
细胞核0.047
排名 4 · LXL04_007580 · OH-1004
溶酶体／液泡0.026
排名 5 · LXL04_007580 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_229-63 aa
PF13855.13LRR_8169-223 aa
PF12799.14LRR_4169-204 aa
PF13855.13LRR_8190-249 aa
PF12799.14LRR_4214-251 aa
PF13855.13LRR_8260-321 aa
PF12799.14LRR_4285-325 aa
PF23598.2LRR_14305-537 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_007580PF08263.18LRRNT_229633e-0731.3
LXL04_007580PF13855.13LRR_81692235.3e-48161.3
LXL04_007580PF12799.14LRR_41692041.2e-40137.4
LXL04_007580PF13855.13LRR_81902495.3e-48161.3
LXL04_007580PF12799.14LRR_42142511.2e-40137.4
LXL04_007580PF13855.13LRR_82603215.3e-48161.3
LXL04_007580PF12799.14LRR_42853251.2e-40137.4
LXL04_007580PF23598.2LRR_143055371.2e-1454.5
LXL04_007580PF13855.13LRR_83103705.3e-48161.3
LXL04_007580PF12799.14LRR_43844201.2e-40137.4
LXL04_007580PF13855.13LRR_83854445.3e-48161.3
LXL04_007580PF13855.13LRR_84585155.3e-48161.3
LXL04_007580PF13855.13LRR_84815405.3e-48161.3
LXL04_007580PF20141.5Island5536176.2e-30103.1
LXL04_007580PF13855.13LRR_86487045.3e-48161.3
LXL04_007580PF00069.32Pkinase84511142.9e-42145.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O22476拟南芥Protein BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 161.744%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LJF3拟南芥Receptor-like protein kinase BRI1-like 347.152%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q942F3水稻Brassinosteroid LRR receptor kinase BRI152.957%Swiss-Prot强数据库同源证据

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