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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_007222
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 40184604-40186206 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1038 bp · LXL04_007222|LXL04_007222|OH1004|cDNA

ATGGCTGGTTTCTTCTCATTAGGATCTGCAACTTATAACCATAGCCAACAAAACCCTAACCTCCCTTCCAATCCAACTTCTAATTCCAATCCTTCTGAATCCAACAGCTGGTTCTTGTACGGTTCATCGAGAAACACAAACACCCATCAACGCCCGACCACCGTCACTAAAGATTTCGAGCTCTGGCAGCAACCTAATGAAGCTGATGAAGTCGCTCATAATTTGTTAGCTGGAGTAGCTAATTCCATGGGTGGCGGCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1038 bp · LXL04_007222|LXL04_007222|OH1004|CDS

ATGGCTGGTTTCTTCTCATTAGGATCTGCAACTTATAACCATAGCCAACAAAACCCTAACCTCCCTTCCAATCCAACTTCTAATTCCAATCCTTCTGAATCCAACAGCTGGTTCTTGTACGGTTCATCGAGAAACACAAACACCCATCAACGCCCGACCACCGTCACTAAAGATTTCGAGCTCTGGCAGCAACCTAATGAAGCTGATGAAGTCGCTCATAATTTGTTAGCTGGAGTAGCTAATTCCATGGGTGGCGGCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

345 aa · LXL04_007222|LXL04_007222|OH1004|PROTEIN

MAGFFSLGSATYNHSQQNPNLPSNPTSNSNPSESNSWFLYGSSRNTNTHQRPTTVTKDFELWQQPNEADEVAHNLLAGVANSMGGGGGGGGAGGDGRLINFQDESTWGSAAFVMMGHGIAGGGSVGGGVSCQDCGNQAKKDCPHMRCRTCCKSRGFHCQTHVKSTWVPAAKRRERQQYNNSGADQDQNRRRIHLNTKRTRSTQDHENPSMINPIAADAVAYNSTSGLEVGNFPSEVTTPANFRCVRVSSIDETDDQYAYQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_007222
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_007222
位置Chr02:40184604-40186206 (-)
描述Similar to EOT1: Protein EXPRESSION OF TERPENOIDS 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g75520 转录激活剂，结合 5'-ACTCTAC-3' 上的 DNA，促进生长素稳态调节基因表达，以及影响雄蕊发育、细胞扩张和开花时间的基因。
Functionally redundant SHI family genes regulate Arabidopsis gynoecium development in a dose-dependent manner.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02774.x
At5g66350 转录激活剂，结合 5'-ACTCTAC-3' 上的 DNA，促进生长素稳态调节基因表达（例如 YUC 基因），以及影响雄蕊发育、细胞扩张和开花时间的基因。 暂无已核实直接文献
At1g19790 转录激活剂，结合 5'-ACTCTAC-3' 上的 DNA，促进生长素稳态调节基因表达，以及影响雄蕊发育、细胞扩张和开花时间的基因。
Functionally redundant SHI family genes regulate Arabidopsis gynoecium development in a dose-dependent manner.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02774.x
Activation tagging of an Arabidopsis SHI-RELATED SEQUENCE gene produces abnormal anther dehiscence and floral development.2010 · DOI: 10.1007/s11103-010-9677-5
At3g51060 转录激活剂，结合 5'-ACTCTAC-3' 上的 DNA，促进生长素稳态调节基因表达（例如 YUC 基因），以及影响雄蕊发育、细胞扩张和开花时间的基因。
STY1 and STY2 promote the formation of apical tissues during Arabidopsis gynoecium development.2002 · DOI: 10.1242/dev.129.20.4707
STY1 regulates auxin homeostasis and affects apical-basal patterning of the Arabidopsis gynoecium.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02775.x
Functionally redundant SHI family genes regulate Arabidopsis gynoecium development in a dose-dependent manner.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02774.x
Auxin can act independently of CRC, LUG, SEU, SPT and STY1 in style development but not apical-basal patterning of the Arabidopsis gynoecium.2008 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2008.02625.x
The Arabidopsis thaliana STYLISH1 protein acts as a transcriptional activator regulating auxin biosynthesis.2010 · DOI: 10.1105/tpc.108.064816
The Arabidopsis thaliana transcriptional activator STYLISH1 regulates genes affecting stamen development, cell expansion and timing of flowering.2012 · DOI: 10.1007/s11103-012-9888-z

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007222 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009299 mRNA transcription 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0009938 negative regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048653 anther development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19790
ath:AT1G75520
ath:AT3G51060
ath:AT5G66350
sly:101251254
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.983
排名 1 · LXL04_007222 · OH-1004
细胞质0.073
排名 2 · LXL04_007222 · OH-1004
细胞膜0.023
排名 3 · LXL04_007222 · OH-1004
内质网0.017
排名 4 · LXL04_007222 · OH-1004
质体0.009
排名 5 · LXL04_007222 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05142.18DUF702128-280 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_007222PF05142.18DUF7021282805.5e-63212.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LQZ5拟南芥Protein SHI RELATED SEQUENCE 550.885%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9XGX0拟南芥Protein SHORT INTERNODES44.481%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FXH7拟南芥Protein SHI RELATED SEQUENCE 750.244%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9SD40拟南芥Protein SHI RELATED SEQUENCE 150.000%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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