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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_006524
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 12772044-12776854 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3465 bp · LXL04_006524|LXL04_006524|OH1004|cDNA

ATGGGTCGTCTTCACAAACCATATAACTTCTTGTTAATTACCTTATTCGTATTCACATCATCTTCTTACTTCCACGCTGTTTCCGGCGATGATTCCGACAAATCGACTCTTCTGGAGTTCAAGGCCGCCGTTTCGGATCCTTCAGGAGTGCTTATGAGCTGGAATTTAAACAGTTCGGATCATTGTTCGTGGATCGGAGTCACATGTGCGTCAGAATCTAGGGTTGTGGCGATTAACATCACAGGTGGAGGTAACGCCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

3465 bp · LXL04_006524|LXL04_006524|OH1004|CDS

ATGGGTCGTCTTCACAAACCATATAACTTCTTGTTAATTACCTTATTCGTATTCACATCATCTTCTTACTTCCACGCTGTTTCCGGCGATGATTCCGACAAATCGACTCTTCTGGAGTTCAAGGCCGCCGTTTCGGATCCTTCAGGAGTGCTTATGAGCTGGAATTTAAACAGTTCGGATCATTGTTCGTGGATCGGAGTCACATGTGCGTCAGAATCTAGGGTTGTGGCGATTAACATCACAGGTGGAGGTAACGCCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1154 aa · LXL04_006524|LXL04_006524|OH1004|PROTEIN

MGRLHKPYNFLLITLFVFTSSSYFHAVSGDDSDKSTLLEFKAAVSDPSGVLMSWNLNSSDHCSWIGVTCASESRVVAINITGGGNAGDFTCSKYNQFPLYGFGIAKNCLDLNAKLVGKLSSAISKLSELRILSLPFNDLSGEIPPEIWGMEKLEVIDLEGNLIHGSLQSHFSGLKNLRVLNLGFNQISGEIPNSISQFKNLQVLNLAGNHINGSIPRILDNFGDLRGLYLSFNQLSGNIPIEIGYNCGNLENLELAGNLF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_006524
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_006524
位置Chr02:12772044-12776854 (-)
描述Similar to RPK2: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g02130 花药发育（如木质化模式）的关键调控因子，参与花粉成熟（如萌发能力形成）期间的绒毡层降解。
Receptor-like protein kinase 2 (RPK 2) is a novel factor controlling anther development in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03083.x
RPK1 and TOAD2 are two receptor-like kinases redundantly required for arabidopsis embryonic pattern formation.2007 · DOI: 10.1016/j.devcel.2007.04.003
Two receptor-like kinases required together for the establishment of Arabidopsis cotyledon primordia.2008 · DOI: 10.1016/j.ydbio.2007.11.021
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献
At1g69270 参与主要的脱落酸（ABA）信号传导途径及早期ABA感知。
Leucine-rich repeat receptor-like kinase1 is a key membrane-bound regulator of abscisic acid early signaling in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.027474
RPK1 and TOAD2 are two receptor-like kinases redundantly required for arabidopsis embryonic pattern formation.2007 · DOI: 10.1016/j.devcel.2007.04.003
Two receptor-like kinases required together for the establishment of Arabidopsis cotyledon primordia.2008 · DOI: 10.1016/j.ydbio.2007.11.021
At1g17230 富含亮氨酸重复序列的受体样丝/苏氨酸蛋白激酶 At1g17230。 暂无已核实直接文献
At5g07280 具有丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶活性的受体，决定雄性孢原细胞起始细胞的正确数量，并进一步决定绒毡层和中间层细胞的特性。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006524 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009808 lignin metabolic process 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0009942 longitudinal axis specification 生物过程
GO:0009945 radial axis specification 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0048508 embryonic meristem development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17230
ath:AT1G69270
ath:AT3G02130
ath:AT5G63930
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.863
排名 1 · LXL04_006524 · OH-1004
内质网0.087
排名 2 · LXL04_006524 · OH-1004
细胞质0.062
排名 3 · LXL04_006524 · OH-1004
细胞核0.046
排名 4 · LXL04_006524 · OH-1004
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · LXL04_006524 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_231-69 aa
PF23598.2LRR_14121-243 aa
PF13855.13LRR_8152-211 aa
PF29594.1LRR_SKP2152-321 aa
PF12799.14LRR_4175-211 aa
PF23598.2LRR_14193-323 aa
PF13855.13LRR_8195-235 aa
PF13855.13LRR_8249-308 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_006524PF08263.18LRRNT_231692.2e-1454.1
LXL04_006524PF23598.2LRR_141212431.3e-2384.1
LXL04_006524PF13855.13LRR_81522111.1e-35121.9
LXL04_006524PF29594.1LRR_SKP21523212.1e-0731.2
LXL04_006524PF12799.14LRR_41752118.5e-30102.8
LXL04_006524PF23598.2LRR_141933231.3e-2384.1
LXL04_006524PF13855.13LRR_81952351.1e-35121.9
LXL04_006524PF13855.13LRR_82493081.1e-35121.9
LXL04_006524PF13855.13LRR_85766341.1e-35121.9
LXL04_006524PF23598.2LRR_146207001.3e-2384.1
LXL04_006524PF12799.14LRR_46466848.5e-30102.8
LXL04_006524PF13855.13LRR_86477061.1e-35121.9
LXL04_006524PF00069.32Pkinase83610331.2e-41143.6
LXL04_006524PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr83710321.9e-36126.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9S7I6拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK261.622%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LVP0拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393034.844%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9ZRF9拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK156.250%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SHI2拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1723034.286%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LYN8拟南芥Leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS132.405%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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