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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_005834
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 174289163-174291719 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1410 bp · LXL04_005834|LXL04_005834|OH1004|cDNA

ATGAACGATGAATCTTCATCACCAAAACCCACAACCCCATCATCTCTAAACTATTACCACCCATCTCCATCGCGCACCATCTACAGCGATCGCTTTATCCCCTCTCGATCCGCATCCAATTTCGCCCTATTTGGTCTCTCTACTCCTCCACCCTCCGACGGAAGTACAAACGCTGACAACGACACTTCTAGTTCTTCTTCCTCAGCCGCCTACACTGCGCTTTTGAGAAAGGCATTGTTCGGGTCGGATCTGGGCGTCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1410 bp · LXL04_005834|LXL04_005834|OH1004|CDS

ATGAACGATGAATCTTCATCACCAAAACCCACAACCCCATCATCTCTAAACTATTACCACCCATCTCCATCGCGCACCATCTACAGCGATCGCTTTATCCCCTCTCGATCCGCATCCAATTTCGCCCTATTTGGTCTCTCTACTCCTCCACCCTCCGACGGAAGTACAAACGCTGACAACGACACTTCTAGTTCTTCTTCCTCAGCCGCCTACACTGCGCTTTTGAGAAAGGCATTGTTCGGGTCGGATCTGGGCGTCGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

469 aa · LXL04_005834|LXL04_005834|OH1004|PROTEIN

MNDESSSPKPTTPSSLNYYHPSPSRTIYSDRFIPSRSASNFALFGLSTPPPSDGSTNADNDTSSSSSSAAYTALLRKALFGSDLGVVPPSTPDKKSSPVATPNPVNRNIFRFKSETRQSLHSLSPFGFDDQSTGVTHRPAKAPRIVPRSPYKVLDAPALQDDFYLNLVDWSSHNVLAVGLSNCVYLWNASSSKVTKLCDLGIDETVCSVSWSQQGTTLAVGTSNGEVQIWDVFGCKKVRSMEGHRSRVGALAWNSSMLSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_005834
TK1151 IDTkA01G013720
OH-1004 IDLXL04_005834
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_005834
位置Chr01:174289163-174291719 (-)
描述Similar to FZR2: Protein FIZZY-RELATED 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g22910 激活蛋白，调节后期促进复合物/环体 的泛素连接酶活性和底物特异性。
Arabidopsis anaphase-promoting complexes: multiple activators and wide range of substrates might keep APC perpetually busy.2005 · DOI: 10.4161/cc.4.8.1856
FZR2/CCS52A1 expression is a determinant of endoreduplication and cell expansion in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.108.132449
APC/C-CCS52A complexes control meristem maintenance in the Arabidopsis root.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0901193106
At4g11920 激活蛋白，调节后期促进复合物/环体 的泛素连接酶活性和底物特异性。
Arabidopsis anaphase-promoting complexes: multiple activators and wide range of substrates might keep APC perpetually busy.2005 · DOI: 10.4161/cc.4.8.1856
APC/C-CCS52A complexes control meristem maintenance in the Arabidopsis root.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0901193106
At5g13840 激活蛋白，调节后期促进复合物/环体 的泛素连接酶活性和底物特异性。
Arabidopsis anaphase-promoting complexes: multiple activators and wide range of substrates might keep APC perpetually busy.2005 · DOI: 10.4161/cc.4.8.1856

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005834 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0008361 regulation of cell size 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程
GO:0009877 nodulation 生物过程
GO:0010091 trichome branching 生物过程
GO:0010492 maintenance of shoot apical meristem identity 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0031145 anaphase-promoting complex-dependent catabolic process 生物过程
GO:0032877 positive regulation of DNA endoreduplication 生物过程
GO:0042023 DNA endoreduplication 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G11920
ath:AT4G22910
ath:AT5G13840
mtr:25493638
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.764
排名 1 · LXL04_005834 · OH-1004
细胞质0.301
排名 2 · LXL04_005834 · OH-1004
细胞膜0.029
排名 3 · LXL04_005834 · OH-1004
溶酶体／液泡0.026
排名 4 · LXL04_005834 · OH-1004
线粒体0.020
排名 5 · LXL04_005834 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24807.2WD40_CDC20-Fz154-443 aa
PF23383.2Beta-prop_IFT140_1st162-231 aa
PF24817.2WD40_WDHD1_1st166-256 aa
PF25168.2Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd168-266 aa
PF25174.2Beta-prop_THOC3170-267 aa
PF23389.2Beta-prop_WDR19_1st170-267 aa
PF23414.2Beta-prop_EML_2172-337 aa
PF25172.2Beta-prop_WDR3_2nd172-267 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_005834PF24807.2WD40_CDC20-Fz1544432.8e-128428.0
LXL04_005834PF23383.2Beta-prop_IFT140_1st1622311.4e-1247.8
LXL04_005834PF24817.2WD40_WDHD1_1st1662564.1e-30105.7
LXL04_005834PF25168.2Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd1682661e-1558.6
LXL04_005834PF25174.2Beta-prop_THOC31702672.1e-41142.5
LXL04_005834PF23389.2Beta-prop_WDR19_1st1702676.2e-2072.2
LXL04_005834PF23414.2Beta-prop_EML_21723374.5e-2589.2
LXL04_005834PF25172.2Beta-prop_WDR3_2nd1722679.6e-2071.7
LXL04_005834PF23381.2Beta-prop_IFT122_1st1732673.6e-42145.3
LXL04_005834PF23775.2Beta-prop_RIG_2nd1742782.8e-1144.1
LXL04_005834PF25173.2Beta-prop_WDR3_1st1752712.2e-40139.1
LXL04_005834PF25171.2Beta-prop_WDR36-Utp21_1st1763132.7e-1144.1
LXL04_005834PF25391.2WD40_Gbeta1792929.5e-1658.4
LXL04_005834PF24814.2WD40_Prp191832523.4e-2692.7
LXL04_005834PF12894.14ANAPC4_WD401842557.9e-1762.0
LXL04_005834PF24796.2WDR551994486.5e-1349.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L3Z8拟南芥Protein FIZZY-RELATED 274.550%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8VZS9拟南芥Protein FIZZY-RELATED 171.965%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8LPL5拟南芥Protein FIZZY-RELATED 360.225%Swiss-Prot强数据库同源证据

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