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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_005043
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 153436843-153437781 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

510 bp · LXL04_005043|LXL04_005043|OH1004|cDNA

ATGGAGTCGGGTCGCATTATTGATGTTCTTGACAAGAAATCCATTTTGGTCACGGGTGCTACTGGTTTTCTAGCAAAAGCTTCAAATATAAATGTAGTTTTTGTGGAGAAGATACTTAGAGTTCAACCAAACGTGAAGAAGCTATATCTCCTTGTAAGAGCAACCGATGCTAAGTCTGCCTTACAACGCTTCAACACCGAGGCAGTAGAAACGGATTTGTTTAAAGTCCTGAAAGAGAAGTACAACACAAACCTACAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

510 bp · LXL04_005043|LXL04_005043|OH1004|CDS

ATGGAGTCGGGTCGCATTATTGATGTTCTTGACAAGAAATCCATTTTGGTCACGGGTGCTACTGGTTTTCTAGCAAAAGCTTCAAATATAAATGTAGTTTTTGTGGAGAAGATACTTAGAGTTCAACCAAACGTGAAGAAGCTATATCTCCTTGTAAGAGCAACCGATGCTAAGTCTGCCTTACAACGCTTCAACACCGAGGCAGTAGAAACGGATTTGTTTAAAGTCCTGAAAGAGAAGTACAACACAAACCTACAAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

169 aa · LXL04_005043|LXL04_005043|OH1004|PROTEIN

MESGRIIDVLDKKSILVTGATGFLAKASNINVVFVEKILRVQPNVKKLYLLVRATDAKSALQRFNTEAVETDLFKVLKEKYNTNLQTFLSEKVILVPGDITCENLGMKDSFMKEQMWRDVEVVVNAAASTKFHERYDVALDINTCGAKFVLDFAKKCINVKLLLHVSTG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_005043
TK1151 IDTkA03G381730
OH-1004 IDLXL04_005043
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)88.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 33.504 / OH-1004 78.107
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_005043
位置Chr01:153436843-153437781 (-)
描述Similar to Alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33790 催化脂肪酰辅酶A还原为脂肪醇。
CER4 encodes an alcohol-forming fatty acyl-coenzyme A reductase involved in cuticular wax production in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.086785
At3g44550 催化脂酰辅酶A还原为脂肪醇。
Three Arabidopsis fatty acyl-coenzyme A reductases, FAR1, FAR4, and FAR5, generate primary fatty alcohols associated with suberin deposition.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.158238
Identification of an Arabidopsis fatty alcohol:caffeoyl-Coenzyme A acyltransferase required for the synthesis of alkyl hydroxycinnamates in root waxes.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.201822
Identification of amino acids conferring chain length substrate specificities on fatty alcohol-forming reductases FAR5 and FAR8 from Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m113.499715
At3g44560 催化脂酰辅酶A还原为脂肪醇。
Identification of amino acids conferring chain length substrate specificities on fatty alcohol-forming reductases FAR5 and FAR8 from Arabidopsis thaliana.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m113.499715
At3g44540 催化脂酰辅酶A还原为脂肪醇。
Three Arabidopsis fatty acyl-coenzyme A reductases, FAR1, FAR4, and FAR5, generate primary fatty alcohols associated with suberin deposition.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.158238
Identification of an Arabidopsis fatty alcohol:caffeoyl-Coenzyme A acyltransferase required for the synthesis of alkyl hydroxycinnamates in root waxes.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.201822

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005043 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010025 wax biosynthetic process 生物过程
GO:0010345 suberin biosynthetic process 生物过程
GO:0035336 long-chain fatty-acyl-CoA metabolic process 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0080019 alcohol-forming very long-chain fatty acyl-CoA reductase activity 分子功能
GO:0102965 alcohol-forming long-chain fatty acyl-CoA reductase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:AAD38039
ath:AT3G44540
ath:AT3G44550
ath:AT3G44560
ath:AT4G33790
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.404
排名 1 · LXL04_005043 · OH-1004
线粒体0.171
排名 2 · LXL04_005043 · OH-1004
过氧化物酶体0.130
排名 3 · LXL04_005043 · OH-1004
内质网0.103
排名 4 · LXL04_005043 · OH-1004
细胞核0.101
排名 5 · LXL04_005043 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07993.19NAD_binding_417-168 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_005043PF07993.19NAD_binding_4171682.3e-36126.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93ZB9拟南芥Fatty acyl-CoA reductase 358.580%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q0WRB0拟南芥Probable fatty acyl-CoA reductase 559.146%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q1PEI6拟南芥Fatty acyl-CoA reductase 859.146%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LXN3拟南芥Probable fatty acyl-CoA reductase 455.488%Swiss-Prot强数据库同源证据

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