基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_005035
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 153375750-153387934
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2388 bp · LXL04_005035|LXL04_005035|OH1004|cDNA
ATGGTTTTCCATTTCCGATGTTTCTCTTTTCCATATGAACAAGATAGAATGCCTCCCGTATCAACCGCATCACACGACAGCACTTTCCATACCGCAAATTCACATTTTGATGCGACACGAATGAACATCCCAGATCTAAACGTAAACAAAAAACTCACGGTTTTCACCCACGCTGAACTTAAATCCGCTACCAAAAACTTTCACGATTCCAACAAACTCGGGGAAGGTGGATTTGCGATCGTATATAAAGGCACagtaaa...
CDS
下载 CDS FASTA2388 bp · LXL04_005035|LXL04_005035|OH1004|CDS
ATGGTTTTCCATTTCCGATGTTTCTCTTTTCCATATGAACAAGATAGAATGCCTCCCGTATCAACCGCATCACACGACAGCACTTTCCATACCGCAAATTCACATTTTGATGCGACACGAATGAACATCCCAGATCTAAACGTAAACAAAAAACTCACGGTTTTCACCCACGCTGAACTTAAATCCGCTACCAAAAACTTTCACGATTCCAACAAACTCGGGGAAGGTGGATTTGCGATCGTATATAAAGGCACAGTAAA...
795 aa · LXL04_005035|LXL04_005035|OH1004|PROTEIN
MVFHFRCFSFPYEQDRMPPVSTASHDSTFHTANSHFDATRMNIPDLNVNKKLTVFTHAELKSATKNFHDSNKLGEGGFAIVYKGTVKTKKNRSTDIDVAVKQIKPGQQGYKTWVTEVNVLGEINHENLVKLIGLCNEDGQLLLVYEYMPKKSLDGHLSAKSNARLSWGRRLHIAKDAAKGLEHLHNSEIVFRDFKPSNILLDNNWNAKLSDFGFARDGPQDGKTHVSTMVVGTKGYAAPEYVQTGRLTTKIDVWSYGIFL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_005035 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_005035 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:153375750-153387934 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to PCRK1: Serine/threonine-protein kinase PCRK1 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002221 pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0009617 response to bacterium 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0045087 innate immune response 生物过程 GO:0080142 regulation of salicylic acid biosynthetic process 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009536 plastid 细胞组分 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G09830 ath:AT5G03320 ath:AT5G47070 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.668
细胞质0.256
细胞核0.198
内质网0.045
高尔基体0.034
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00069.32Pkinase67-337 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr70-337 aaPF00069.32Pkinase443-709 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr445-709 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_005035 | PF00069.32 | Pkinase | 67 | 337 | 7.8e-100 | 334.3 |
| LXL04_005035 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 70 | 337 | 2.1e-93 | 313.1 |
| LXL04_005035 | PF00069.32 | Pkinase | 443 | 709 | 7.8e-100 | 334.3 |
| LXL04_005035 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 445 | 709 | 2.1e-93 | 313.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SF86 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase PCRK1 | 65.570% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9LZF8 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase PCRK2 | 63.990% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9LTC0 | 拟南芥 | Probable serine/threonine-protein kinase PBL19 | 51.335% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9LFP7 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase PBL34 | 51.796% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SRH7 | 拟南芥 | Serine/threonine-protein kinase PBL35 | 51.360% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |