基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_004403
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 134745739-134746149
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA411 bp · LXL04_004403|LXL04_004403|OH1004|cDNA
ATGGCTCGTACTAAGCAGACGGCAAGGAAATCCACCGGAGGAAAGGCTCCGAGGAAGCAATTGGCCACTAAGGCGGCAAGGAAGTCAGCTCCGGCTACCGGCGGAGTGAAGAAGCCACATAGATTTAGGCCTGGAACAGTGGCACTGAGAGAGATTAGGAAATACCAGAAGAGCACTGAGCTTTTGATCCGGAAACTTCCGTTCCAGAGGCTTGTGAGGGAAATCGCTCAAGATTTCAAGACCGATCTGCGATTCCAGAG...
CDS
下载 CDS FASTA411 bp · LXL04_004403|LXL04_004403|OH1004|CDS
ATGGCTCGTACTAAGCAGACGGCAAGGAAATCCACCGGAGGAAAGGCTCCGAGGAAGCAATTGGCCACTAAGGCGGCAAGGAAGTCAGCTCCGGCTACCGGCGGAGTGAAGAAGCCACATAGATTTAGGCCTGGAACAGTGGCACTGAGAGAGATTAGGAAATACCAGAAGAGCACTGAGCTTTTGATCCGGAAACTTCCGTTCCAGAGGCTTGTGAGGGAAATCGCTCAAGATTTCAAGACCGATCTGCGATTCCAGAG...
136 aa · LXL04_004403|LXL04_004403|OH1004|PROTEIN
MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRFRPGTVALREIRKYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVAALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDMQLARRIRGERA
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_004403 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_004403 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:134745739-134746149 (+) | |||||||||
| 描述 | Similar to B34: Histone H3.2 | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。 水稻
| |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0031507 heterochromatin formation 生物过程 GO:0000786 nucleosome 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0003677 DNA binding 分子功能 GO:0030527 structural constituent of chromatin 分子功能 GO:0031492 nucleosomal DNA binding 分子功能 GO:0046982 protein heterodimerization activity 分子功能 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | dosa:Os01g0866200 dosa:Os04g0419600 dosa:Os05g0438700 dosa:Os06g0160100 dosa:Os11g0155900 nta:107759185 nta:107759464 nta:107763111 nta:107769564 nta:107794615 nta:107798424 nta:107816172 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.963
细胞质0.072
细胞外0.022
细胞膜0.009
线粒体0.007
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00125.31Histone44-131 aaPF15511.13CENP-T_C69-130 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_004403 | PF00125.31 | Histone | 44 | 131 | 2.2e-38 | 131.2 |
| LXL04_004403 | PF15511.13 | CENP-T_C | 69 | 130 | 9.2e-06 | 26.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。