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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_004330
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 132915671-132918370 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2700 bp · LXL04_004330|LXL04_004330|OH1004|cDNA

ATGGATCCTTTTGTTTTTATAATCTTCTCACTTCTCTTACTAAACCAAAAGACCACAATTGCCAAACAATTGAACAAGTGTTTGGATGAAGAAAGACATGCTCTCCTTCATTTTAAATCTCGCCTTCAAGACCCCGATAGTGTTCTCTCTACATGGATAGCTAACGAACATGACTGCTGTAAATGGAGACGAATCACGTGCAACAACAAAACAGGTCGTGTCACAGAGCTTGATATCAACAACTATAATATCGGAGGTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2700 bp · LXL04_004330|LXL04_004330|OH1004|CDS

ATGGATCCTTTTGTTTTTATAATCTTCTCACTTCTCTTACTAAACCAAAAGACCACAATTGCCAAACAATTGAACAAGTGTTTGGATGAAGAAAGACATGCTCTCCTTCATTTTAAATCTCGCCTTCAAGACCCCGATAGTGTTCTCTCTACATGGATAGCTAACGAACATGACTGCTGTAAATGGAGACGAATCACGTGCAACAACAAAACAGGTCGTGTCACAGAGCTTGATATCAACAACTATAATATCGGAGGTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

899 aa · LXL04_004330|LXL04_004330|OH1004|PROTEIN

MDPFVFIIFSLLLLNQKTTIAKQLNKCLDEERHALLHFKSRLQDPDSVLSTWIANEHDCCKWRRITCNNKTGRVTELDINNYNIGGEISNSLLNLSYLSYLDLSGNSFHGAIPTIIGSLTRLKYLNLGYNNLNGTIPKSIGSLIELRNLDLSYTSLYGTIPPELGNLTNLQTLSLGSNGGCRVENLEWLSTLSHLEELDMSGVSLAKANHWVNVVSSLQKLSQLSLWGCELSQVMYPYSSFVNSSSYINTLDLGDNNLTS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_004330
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_004330
位置Chr01:132915671-132918370 (+)
描述Similar to EIX2: Receptor-like protein EIX2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g05660 类受体蛋白33。 暂无已核实直接文献
At1g71400 参与CLV3及CLV3样肽的感知，这些肽作为调节分生组织维护的细胞外信号。
Functional analyses of the CLAVATA2-like proteins and their domains that contribute to CLAVATA2 specificity.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.148197
At4g13920 类受体蛋白 50。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004330 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002220 innate immune response activating cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G71400
ath:AT3G05660
ath:AT4G13920
sly:543900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.866
排名 1 · LXL04_004330 · OH-1004
内质网0.088
排名 2 · LXL04_004330 · OH-1004
细胞质0.056
排名 3 · LXL04_004330 · OH-1004
细胞核0.041
排名 4 · LXL04_004330 · OH-1004
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · LXL04_004330 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_229-68 aa
PF23598.2LRR_1484-266 aa
PF13855.13LRR_897-156 aa
PF29594.1LRR_SKP2144-282 aa
PF13855.13LRR_8273-327 aa
PF23598.2LRR_14274-431 aa
PF13855.13LRR_8345-384 aa
PF12799.14LRR_4423-468 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_004330PF08263.18LRRNT_229685.2e-1246.5
LXL04_004330PF23598.2LRR_14842663.5e-36125.4
LXL04_004330PF13855.13LRR_8971562.8e-44149.4
LXL04_004330PF29594.1LRR_SKP21442824.5e-0626.8
LXL04_004330PF13855.13LRR_82733272.8e-44149.4
LXL04_004330PF23598.2LRR_142744313.5e-36125.4
LXL04_004330PF13855.13LRR_83453842.8e-44149.4
LXL04_004330PF12799.14LRR_44234682.3e-34117.4
LXL04_004330PF23598.2LRR_145215973.5e-36125.4
LXL04_004330PF13855.13LRR_85245552.8e-44149.4
LXL04_004330PF13855.13LRR_87057522.8e-44149.4
LXL04_004330PF23598.2LRR_147117943.5e-36125.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4J8G2拟南芥Receptor-like protein 3330.426%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9C9H7拟南芥Receptor-like protein 1231.544%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q93YT3拟南芥Receptor-like protein 5032.320%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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