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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_004091
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 124829027-124834701 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2436 bp · LXL04_004091|LXL04_004091|OH1004|cDNA

ATGAAGCGTTATATGCAACCATTAAACCCTATAAATCTTCTACCCGAAAACAGAAACATTCCAACGAAAATGCTCCACCTCCAGACAGCAACGCCATTTCAGATTCATTTATACAGGGAAACCATCTCCCGTTCTGCCTGTAAATTGAAATCGCCACTCCCACCAAGACCTCCTCCGTCTAGTTCTCTCAAGCGGAAGCTTAGTAATGAATTGCCTCTGGAAAATGGTGTTGCTGGATCTTCGGATACAGGAGTGAAGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

2436 bp · LXL04_004091|LXL04_004091|OH1004|CDS

ATGAAGCGTTATATGCAACCATTAAACCCTATAAATCTTCTACCCGAAAACAGAAACATTCCAACGAAAATGCTCCACCTCCAGACAGCAACGCCATTTCAGATTCATTTATACAGGGAAACCATCTCCCGTTCTGCCTGTAAATTGAAATCGCCACTCCCACCAAGACCTCCTCCGTCTAGTTCTCTCAAGCGGAAGCTTAGTAATGAATTGCCTCTGGAAAATGGTGTTGCTGGATCTTCGGATACAGGAGTGAAGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

811 aa · LXL04_004091|LXL04_004091|OH1004|PROTEIN

MKRYMQPLNPINLLPENRNIPTKMLHLQTATPFQIHLYRETISRSACKLKSPLPPRPPPSSSLKRKLSNELPLENGVAGSSDTGVKVIVRMRPPRKNEEEGEIIVQKTSGDSLSILRQPFTFDSIGKPAPVSSKESSAAGKDDDEEWDDLDLRAASAIRLSLAKNVLANVHGISTAKELWEKLEQLYQGKGISNRLYLKEQFHTLRMNGDTKISDHLSVLNNIVSELEAIGVKVEDEDKALRLILSLPSSYEHMKPILMY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_004091
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_004091
位置Chr01:124829027-124834701 (-)
描述Similar to KIN12A: Kinesin-like protein KIN-12A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g14150 Plus 端定向的驱动蛋白样运动酶，在胞质分裂过程中成膜体微管的组织中发挥关键作用。
Identification of a phragmoplast-associated kinesin-related protein in higher plants.2000 · DOI: 10.1016/s0960-9822(00)00564-9
Two Arabidopsis phragmoplast-associated kinesins play a critical role in cytokinesis during male gametogenesis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050716
At3g23670 Plus 端定向的驱动蛋白样运动酶，在胞质分裂过程中成膜体微管的组织中发挥关键作用。
Two Arabidopsis phragmoplast-associated kinesins play a critical role in cytokinesis during male gametogenesis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050716
At3g19050 通过适当的成膜体引导参与胞质分裂的空间控制。
Two kinesins are involved in the spatial control of cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1016/j.cub.2006.03.034

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0350300 Plus 端定向的驱动蛋白样运动酶，在胞质分裂过程中成膜体微管的组织中发挥关键作用。 暂无已核实直接文献
Os02g0489800 类驱动蛋白KIN-12B。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004091 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0007112 male meiosis cytokinesis 生物过程
GO:0055046 microgametogenesis 生物过程
GO:0080175 phragmoplast microtubule organization 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005871 kinesin complex 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009524 phragmoplast 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G23670
ath:AT4G14150
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.477
排名 1 · LXL04_004091 · OH-1004
细胞质0.462
排名 2 · LXL04_004091 · OH-1004
细胞膜0.071
排名 3 · LXL04_004091 · OH-1004
线粒体0.064
排名 4 · LXL04_004091 · OH-1004
内质网0.047
排名 5 · LXL04_004091 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14223.15Retrotran_gag_2135-283 aa
PF00225.30Kinesin297-572 aa
PF16796.12Microtub_bd318-392 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_004091PF14223.15Retrotran_gag_21352831.2e-33116.9
LXL04_004091PF00225.30Kinesin2975725.6e-84282.6
LXL04_004091PF16796.12Microtub_bd3183921e-0835.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LDN0拟南芥Kinesin-like protein KIN-12A75.000%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q8L7Y8拟南芥Kinesin-like protein KIN-12B73.754%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q27IK6拟南芥Kinesin-like protein KIN-12D38.899%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q7XKR9水稻Kinesin-like protein KIN-12A68.543%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q6K765水稻Kinesin-like protein KIN-12B69.307%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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