LXL04_002739 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_002739

当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 56775400-56777320 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1389 bp · LXL04_002739|LXL04_002739|OH1004|cDNA

ATGACCATTTTAAATGATAAGAAAATGGGATCCATGATACCTAAGTTTATATTTATTGGCTATATTTTCTTGTGCTATTTGGAGAATGTCAATGGTGGTGTCACAAGCACTTTCATACGTTCAGAATGGCCATCAGTTGATATTCCTCTTGATAATGAAGTATTTGTGAAACCCAAAGGTCCTAATGCACCAGAGCAGGTACATATCACTCAAGGAGATTATGATGGAAAAGGCATGATCATAATATGGGTGACACCTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1389 bp · LXL04_002739|LXL04_002739|OH1004|CDS

ATGACCATTTTAAATGATAAGAAAATGGGATCCATGATACCTAAGTTTATATTTATTGGCTATATTTTCTTGTGCTATTTGGAGAATGTCAATGGTGGTGTCACAAGCACTTTCATACGTTCAGAATGGCCATCAGTTGATATTCCTCTTGATAATGAAGTATTTGTGAAACCCAAAGGTCCTAATGCACCAGAGCAGGTACATATCACTCAAGGAGATTATGATGGAAAAGGCATGATCATAATATGGGTGACACCTGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

462 aa · LXL04_002739|LXL04_002739|OH1004|PROTEIN

MTILNDKKMGSMIPKFIFIGYIFLCYLENVNGGVTSTFIRSEWPSVDIPLDNEVFVKPKGPNAPEQVHITQGDYDGKGMIIIWVTPDEPGSNQVKYGTSEKKYDFTAKGETVKNYTFYNYTSGYIHQCHLENLEYDTKYYYEIGEGDSARSFWFQTPPKIDPNASYKFGIIGDLGQTYNSLSTLEHYIESGAQTVLHVGDLSYADRYKYHDMGVRWDSYGRFVEKIAAYQPWIWTTGNHEIEYMPYMNEVTPFKQYLYRY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_002739`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_002739

位置 Chr01:56775400-56777320 (-)

描述 Similar to PAP26: Bifunctional purple acid phosphatase 26

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g34850`	参与磷酸盐代谢的金属磷酸酯酶。	Biochemical and molecular characterization of AtPAP26, a vacuolar purple acid phosphatase up-regulated in phosphate-deprived Arabidopsis suspension cells and seedlings.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.087171
`At2g27190`	Fe³⁺-Zn²⁺ 紫色酸性磷酸酶12。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002739 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程

GO:0042744 hydrogen peroxide catabolic process 生物过程

GO:0051174 regulation of phosphorus metabolic process 生物过程

GO:0055062 phosphate ion homeostasis 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005615 extracellular space 细胞组分

GO:0005773 vacuole 细胞组分

GO:0005775 vacuolar lumen 细胞组分

GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

GO:0099503 secretory vesicle 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G27190

ath:AT5G34850

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.329

排名 1 · LXL04_002739 · OH-1004

细胞外0.305

排名 2 · LXL04_002739 · OH-1004

细胞膜0.191

排名 3 · LXL04_002739 · OH-1004

细胞质0.162

排名 4 · LXL04_002739 · OH-1004

内质网0.110

排名 5 · LXL04_002739 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16656.12Pur_ac_phosph_N64-155 aa

PF00149.34Metallophos167-364 aa

PF14008.12Metallophos_C390-450 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_002739	`PF16656.12`	Pur_ac_phosph_N	64	155	5.7e-22	78.8
LXL04_002739	`PF00149.34`	Metallophos	167	364	2.8e-25	90.6
LXL04_002739	`PF14008.12`	Metallophos_C	390	450	3e-22	79.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q949Y3`	拟南芥	Bifunctional purple acid phosphatase 26	73.128%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q38924`	拟南芥	Fe(3+)-Zn(2+) purple acid phosphatase 12	57.080%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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