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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_002096
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 41614535-41618531 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1638 bp · LXL04_002096|LXL04_002096|OH1004|cDNA

ATGGCGACTCTTCATGTAGATTCAGCCCTTGACTTCATCCGACACCACCTTCTCAATGATTACGAAGCCCCTGATTGCTCCCCCGAGCCATCGATTTCTGGATCTGGACTATCAGTATTTGATTATCTCGACTTTCAGGAAGAAACCACGTCCCAATTCATGGTTCCAGAGTCGATTGATAGTAGATCTGGACAATCATATCTGAAAGAAACCGAGTGCGTTGAGGAGGCTCAGGCGAACGTACACTACAGAGGAGTACG...

CDS

下载 CDS FASTA

1638 bp · LXL04_002096|LXL04_002096|OH1004|CDS

ATGGCGACTCTTCATGTAGATTCAGCCCTTGACTTCATCCGACACCACCTTCTCAATGATTACGAAGCCCCTGATTGCTCCCCCGAGCCATCGATTTCTGGATCTGGACTATCAGTATTTGATTATCTCGACTTTCAGGAAGAAACCACGTCCCAATTCATGGTTCCAGAGTCGATTGATAGTAGATCTGGACAATCATATCTGAAAGAAACCGAGTGCGTTGAGGAGGCTCAGGCGAACGTACACTACAGAGGAGTACG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

545 aa · LXL04_002096|LXL04_002096|OH1004|PROTEIN

MATLHVDSALDFIRHHLLNDYEAPDCSPEPSISGSGLSVFDYLDFQEETTSQFMVPESIDSRSGQSYLKETECVEEAQANVHYRGVRRRPWGKYAAEIRDPKRSGRRVWLGTFDTSIEAAKAYDRAAFEMRGRKAILNFPLEIGNSRSDTVAIAGGCRKRIRDVEQMVVEVKKEKIVETVDVPLTPSSWKVIWDEDWYGLLNGHLLSPISGGLVFPTPVALVNSSKTSPNSSMDAIGVLLTFPMSPYLEQELDKRFNLFR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_002096
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_002096
位置Chr01:41614535-41618531 (-)
描述Similar to HPPR: Hydroxyphenylpyruvate reductase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g79870 催化细胞质中的乙醛酸和羟基丙酮酸 依赖 NADPH 还原为乙醇酸和甘油酸，从而为光呼吸核心循环提供胞质旁路。
A cytosolic pathway for the conversion of hydroxypyruvate to glycerate during photorespiration in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1105/tpc.108.062265
The hydroxypyruvate-reducing system in Arabidopsis: multiple enzymes for the same end.2011 · DOI: 10.1104/pp.110.166538
At1g12550 催化乙醛酸和羟基丙酮酸 依赖 NADPH 还原成乙醇酸和甘油酸。
The hydroxypyruvate-reducing system in Arabidopsis: multiple enzymes for the same end.2011 · DOI: 10.1104/pp.110.166538

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002096 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009853 photorespiration 生物过程
GO:0009854 oxidative photosynthetic carbon pathway 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0008465 hydroxypyruvate reductase (NADH) activity 分子功能
GO:0008720 D-lactate dehydrogenase (NAD+) activity 分子功能
GO:0016618 hydroxypyruvate reductase [NAD(P)H] activity 分子功能
GO:0030267 glyoxylate reductase (NADPH) activity 分子功能
GO:0047964 glyoxylate reductase (NADH) activity 分子功能
GO:0047995 (2R)-hydroxyphenylpyruvate reductase [NAD(P)H] activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:CAD47810
ath:AT1G12550
ath:AT1G79870
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.645
排名 1 · LXL04_002096 · OH-1004
细胞质0.350
排名 2 · LXL04_002096 · OH-1004
质体0.079
排名 3 · LXL04_002096 · OH-1004
细胞膜0.041
排名 4 · LXL04_002096 · OH-1004
内质网0.035
排名 5 · LXL04_002096 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00847.27AP282-132 aa
PF00389.372-Hacid_dh242-544 aa
PF02826.262-Hacid_dh_C341-513 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_002096PF00847.27AP2821329.1e-1658.6
LXL04_002096PF00389.372-Hacid_dh2425443.6e-2382.4
LXL04_002096PF02826.262-Hacid_dh_C3415132.8e-54183.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9CA90拟南芥Glyoxylate/hydroxypyruvate reductase A HPR270.927%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LE33拟南芥Glyoxylate/hydroxypyruvate reductase HPR351.264%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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