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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_001034
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 18895316-18897723 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

828 bp · LXL04_001034|LXL04_001034|OH1004|cDNA

atggcTTTCAAAATGGTTAGGGTGGCTCTAGCCATGGTCGTTATTGTCTCAATTTGTGGTGGAACCATGGCTCAGTCTGGGTGCACCAGTGCCCTTATGGGTATGTCTCCCTGCCTAAACTTCATTacaggaaacatatccaccCCATCGTCTTCATGTTGCTCACAACTTGGAAACCTCGTTCAATCTCAACCACAATGTCTTTGTTCGGTGCTTAATGGAAACGGGATCAATCTTGGTATCAGTATTAACCGAACATT...

CDS

下载 CDS FASTA

828 bp · LXL04_001034|LXL04_001034|OH1004|CDS

ATGGCTTTCAAAATGGTTAGGGTGGCTCTAGCCATGGTCGTTATTGTCTCAATTTGTGGTGGAACCATGGCTCAGTCTGGGTGCACCAGTGCCCTTATGGGTATGTCTCCCTGCCTAAACTTCATTACAGGAAACATATCCACCCCATCGTCTTCATGTTGCTCACAACTTGGAAACCTCGTTCAATCTCAACCACAATGTCTTTGTTCGGTGCTTAATGGAAACGGGATCAATCTTGGTATCAGTATTAACCGAACATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

275 aa · LXL04_001034|LXL04_001034|OH1004|PROTEIN

MAFKMVRVALAMVVIVSICGGTMAQSGCTSALMGMSPCLNFITGNISTPSSSCCSQLGNLVQSQPQCLCSVLNGNGINLGISINRTLALALPGACNVQTPPVSQCNASNGPGTSSTPSPSSSPEGSTNEPDILPESPTESDSPSVMVMVMLCDGTTVESSKCRSALVSLSPCLNYVSGNSSTPSHPCCSQLANVVRSEPRCLCVLVDGGNSATSLNINETLALGLPDVCNVHTPPVSRCDGNGTQSVPATSGGTTISLPF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_001034
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_001034
位置Chr01:18895316-18897723 (+)
描述Similar to LTPG2: Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g22600 参与种子和胚珠成熟发育的脂质转移蛋白，可能通过调控木栓质和孢粉素生物合成或沉积过程中的脂肪酸稳态发挥作用。
Involvement of lipid transfer proteins in resistance against a non-host powdery mildew in Arabidopsis thaliana.2019 · DOI: 10.1111/mpp.12740
At2g48130 可能的脂质转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g14815 可能的脂质转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g03103 可能的脂质转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g43720 脂质转运蛋白，与 LTPG1 一起结合脂质，并作为表皮细胞向表面广泛输出细胞内脂质（例如 C29 烷烃）的角质层脂质输出机制的组成部分，以构建角质蜡层和长角果壁。
Characterization of glycosylphosphatidylinositol-anchored lipid transfer protein 2 (LTPG2) and overlapping function between LTPG/LTPG1 and LTPG2 in cuticular wax export or accumulation in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1093/pcp/pcs083
Involvement of lipid transfer proteins in resistance against a non-host powdery mildew in Arabidopsis thaliana.2019 · DOI: 10.1111/mpp.12740

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001034 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0002240 response to molecule of oomycetes origin 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0006869 lipid transport 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0010214 seed coat development 生物过程
GO:0015908 fatty acid transport 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G48130
ath:AT3G22600
ath:AT4G14815
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.398
排名 1 · LXL04_001034 · OH-1004
细胞外0.260
排名 2 · LXL04_001034 · OH-1004
内质网0.147
排名 3 · LXL04_001034 · OH-1004
细胞质0.108
排名 4 · LXL04_001034 · OH-1004
溶酶体／液泡0.068
排名 5 · LXL04_001034 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14368.12LTP_211-105 aa
PF00234.28Tryp_alpha_amyl28-105 aa
PF14368.12LTP_2146-239 aa
PF00234.28Tryp_alpha_amyl162-239 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_001034PF14368.12LTP_2111053e-34117.8
LXL04_001034PF00234.28Tryp_alpha_amyl281053.6e-2485.5
LXL04_001034PF14368.12LTP_21462393e-34117.8
LXL04_001034PF00234.28Tryp_alpha_amyl1622393.6e-2485.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LJ86拟南芥Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 549.333%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q7EB72拟南芥Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 1544.203%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q2PE59拟南芥Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 2644.882%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
F4HZB9拟南芥Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 1942.759%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LZH5拟南芥Non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 244.048%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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