RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_000906
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 16540634-16550348 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

7071 bp · LXL04_000906|LXL04_000906|OH1004|cDNA

ATGGCAGCATTCGAAAGCATTTCAAATCTGGTTTTTTACATTGTCGTTTTTTCTTTACTGCCATTAAAAGCCACATCGACATCAACTACACAAGCACAAGCTTTGATTAAATGGAAGCGTACCTTATTATCGTCTTCTGATGATGGCTTACTGGATTCATGGTCTTCTGGAAGCATTCAGAAGCTCTGCAACTGGACTGGTATTGTGTGCAATGAAGGTGGTACAGTTTCTGAAATTACCCTCCAAGAATCGTCACTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

7071 bp · LXL04_000906|LXL04_000906|OH1004|CDS

ATGGCAGCATTCGAAAGCATTTCAAATCTGGTTTTTTACATTGTCGTTTTTTCTTTACTGCCATTAAAAGCCACATCGACATCAACTACACAAGCACAAGCTTTGATTAAATGGAAGCGTACCTTATTATCGTCTTCTGATGATGGCTTACTGGATTCATGGTCTTCTGGAAGCATTCAGAAGCTCTGCAACTGGACTGGTATTGTGTGCAATGAAGGTGGTACAGTTTCTGAAATTACCCTCCAAGAATCGTCACTTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

2356 aa · LXL04_000906|LXL04_000906|OH1004|PROTEIN

MAAFESISNLVFYIVVFSLLPLKATSTSTTQAQALIKWKRTLLSSSDDGLLDSWSSGSIQKLCNWTGIVCNEGGTVSEITLQESSLSGTLTEFDFSSFPNLTHFNLSNNEFGGSIPSAIGNLSSIMFLDLSSNVLEDGIPLEIGRLRELRYLNLNDNSLNGVIPFQISNLQKVWYLDLGANYLTDPDWSDFSSMPALTFLNFYLNELKNGFPGFILNCKKLTFLDLSINHFNGTLPESLFTNLNNIEYFKISENSFEGQL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_000906
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_000906
位置Chr01:16540634-16550348 (-)
描述Similar to MIK2: MDIS1-interacting receptor like kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g08850 作为十字花科植物SCOOP肽的受体，调节包括植物生长、发育和应激反应在内的多种过程。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
Perception of a divergent family of phytocytokines by the Arabidopsis receptor kinase MIK2.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-20932-y
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w
The MIK2/SCOOP Signaling System Contributes to Arabidopsis Resistance Against Herbivory by Modulating Jasmonate and Indole Glucosinolate Biosynthesis.2022 · DOI: 10.3389/fpls.2022.852808
At1g35710 可能的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At1g35710。 暂无已核实直接文献
At4g20140 与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸／苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At5g44700 与 GSO1 一起，是在胚胎和子叶表皮表面发育过程中所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At1g17230 富含亮氨酸重复序列的受体样丝/苏氨酸蛋白激酶 At1g17230。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000906 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002213 defense response to insect 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0009695 jasmonic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009759 indole glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0031349 positive regulation of defense response 生物过程
GO:0080027 response to herbivore 生物过程
GO:1901653 cellular response to peptide 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G35710
ath:AT4G08850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.850
排名 1 · LXL04_000906 · OH-1004
内质网0.088
排名 2 · LXL04_000906 · OH-1004
细胞质0.061
排名 3 · LXL04_000906 · OH-1004
细胞核0.041
排名 4 · LXL04_000906 · OH-1004
溶酶体／液泡0.031
排名 5 · LXL04_000906 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_230-71 aa
PF13855.13LRR_894-135 aa
PF23598.2LRR_14100-300 aa
PF13855.13LRR_8147-201 aa
PF13855.13LRR_8176-231 aa
PF13855.13LRR_8220-280 aa
PF23598.2LRR_14286-420 aa
PF13855.13LRR_8292-351 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_000906PF08263.18LRRNT_230713e-1350.5
LXL04_000906PF13855.13LRR_8941352.1e-83274.7
LXL04_000906PF23598.2LRR_141003001.6e-72244.9
LXL04_000906PF13855.13LRR_81472012.1e-83274.7
LXL04_000906PF13855.13LRR_81762312.1e-83274.7
LXL04_000906PF13855.13LRR_82202802.1e-83274.7
LXL04_000906PF23598.2LRR_142864201.6e-72244.9
LXL04_000906PF13855.13LRR_82923512.1e-83274.7
LXL04_000906PF23598.2LRR_143794661.6e-72244.9
LXL04_000906PF13855.13LRR_83914492.1e-83274.7
LXL04_000906PF13855.13LRR_84144732.1e-83274.7
LXL04_000906PF23598.2LRR_144575171.6e-72244.9
LXL04_000906PF13855.13LRR_86066662.1e-83274.7
LXL04_000906PF23598.2LRR_146277021.6e-72244.9
LXL04_000906PF12799.14LRR_46817186.9e-64211.1
LXL04_000906PF13855.13LRR_86827382.1e-83274.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZG8拟南芥MDIS1-interacting receptor like kinase 242.381%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LP24拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g3571038.163%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGQ5拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO135.098%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FIZ3拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO234.726%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SHI2拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1723037.100%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

JBrowse

在基因组浏览器中查看