基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_000106
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 2435120-2435674
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA555 bp · LXL04_000106|LXL04_000106|OH1004|cDNA
ATGGAAACGCCTACTAAACGACCTTTTCATAAATCCATTTCCAGTAACTCCTTCCACCTCCGTTCTCCCAGTCTCAATTCCGTCCGTCTCCGCCGTATCTTCGATCTCTACGACGCCAATCACGACTCCTTCATCACCGTCGACGAGATCAGCACTGCCTTAAAAACCCTCGGCCTCGACACCGACATCTCCGATTTGGATTCAATGATAAAGTCATACATCCATCCTGGCAACGCCGGCCTCACCTACGACGATTTCGT...
CDS
下载 CDS FASTA555 bp · LXL04_000106|LXL04_000106|OH1004|CDS
ATGGAAACGCCTACTAAACGACCTTTTCATAAATCCATTTCCAGTAACTCCTTCCACCTCCGTTCTCCCAGTCTCAATTCCGTCCGTCTCCGCCGTATCTTCGATCTCTACGACGCCAATCACGACTCCTTCATCACCGTCGACGAGATCAGCACTGCCTTAAAAACCCTCGGCCTCGACACCGACATCTCCGATTTGGATTCAATGATAAAGTCATACATCCATCCTGGCAACGCCGGCCTCACCTACGACGATTTCGT...
184 aa · LXL04_000106|LXL04_000106|OH1004|PROTEIN
METPTKRPFHKSISSNSFHLRSPSLNSVRLRRIFDLYDANHDSFITVDEISTALKTLGLDTDISDLDSMIKSYIHPGNAGLTYDDFVILHKSINDLLFGMEDLQLPGGNVTEQEESDLTEAFKVFDEDGDGFISATELQMVLGKLGFTEATEMESVKMMISSVDVNHDGQVDFSEFKDMMKALQ
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_000106 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_000106 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:2435120-2435674 (-) | |||||||||||||||
| 描述 | Similar to CML42: Calcium-binding protein CML42 | |||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0010091 trichome branching 生物过程 GO:0051592 response to calcium ion 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0005509 calcium ion binding 分子功能 GO:0061891 calcium ion sensor activity 分子功能 | |||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G20780 ath:AT5G44460 dosa:Os03g0331700 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.653
细胞核0.379
细胞膜0.067
内质网0.056
溶酶体／液泡0.052
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF13499.13EF-hand_729-88 aaPF13405.13EF-hand_629-58 aaPF00036.39EF-hand_130-57 aaPF24548.2EF_EFCAB10_C31-65 aaPF23564.2EF-hand_FSTL1113-181 aaPF13499.13EF-hand_7115-181 aaPF00036.39EF-hand_1118-144 aaPF13405.13EF-hand_6118-146 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_000106 | PF13499.13 | EF-hand_7 | 29 | 88 | 1.2e-24 | 87.2 |
| LXL04_000106 | PF13405.13 | EF-hand_6 | 29 | 58 | 1e-21 | 75.2 |
| LXL04_000106 | PF00036.39 | EF-hand_1 | 30 | 57 | 5.8e-23 | 79.4 |
| LXL04_000106 | PF24548.2 | EF_EFCAB10_C | 31 | 65 | 9.1e-08 | 32.4 |
| LXL04_000106 | PF23564.2 | EF-hand_FSTL1 | 113 | 181 | 2.2e-07 | 32.0 |
| LXL04_000106 | PF13499.13 | EF-hand_7 | 115 | 181 | 1.2e-24 | 87.2 |
| LXL04_000106 | PF00036.39 | EF-hand_1 | 118 | 144 | 5.8e-23 | 79.4 |
| LXL04_000106 | PF13405.13 | EF-hand_6 | 118 | 146 | 1e-21 | 75.2 |
| LXL04_000106 | PF13202.13 | EF-hand_5 | 121 | 141 | 4.8e-16 | 58.1 |
| LXL04_000106 | PF13833.13 | EF-hand_8 | 133 | 182 | 7.4e-08 | 32.7 |
| LXL04_000106 | PF00036.39 | EF-hand_1 | 156 | 183 | 5.8e-23 | 79.4 |
| LXL04_000106 | PF13202.13 | EF-hand_5 | 163 | 180 | 4.8e-16 | 58.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。