CRISPR 编辑靶点设计
输入基因 ID、CDS、cDNA 或 DNA 序列，快速筛选 SpCas9（NGG PAM）候选靶点并按公开规则排序。页面只提供靶点与评分，不生成载体相关引物，也不将评分视作实验编辑效率。
查看算法、评分及证据边界
单次最多 250,000 bp；在完整输入上扫描两条链，超限会明确提示，不会删除歧义碱基或静默截断。
设计与评分规则
工具在正、负链扫描 20 nt guide 紧邻的 SpCas9 NGG PAM；切割位点按 SpCas9 规则标为 PAM 上游 3 bp。每条候选的总分限制在 0–100，仅用于本工具内的优先排序。
| 组成 | 规则与分值 |
|---|---|
| 基础与 GC 平衡 | 基础分 38；加 max(0, 24 − 1.15 × |GC% − 50|)，因此 GC 接近 50% 时最高加 24 分。 |
| PAM / 5′ 偏好 | NGG PAM 加 10；guide 首位为 G 加 6；在输入序列较靠前的位置加 0–18 分，用于优先靠近基因或 CDS/cDNA 5′端的候选。 |
| 序列惩罚 | guide 含 TTTT 减 12；任一单碱基连续 5 个及以上减 8。最后将结果截断为 0–100。 |
评分是可复现的序列优先级规则，不是体内编辑效率或脱靶风险预测。后续载体、启动子、递送方式和靶外验证应由具体实验体系单独确定。
候选靶点
尚无结果；请输入基因 ID 或有效 DNA 序列。