共表达

已接入 TKU 统一模型 v4 的 TPM 和独立 OH-1004 数据集;各研究分别计算 log2(TPM+1) Pearson 候选相关,不合并不同研究的样本。两样本研究排除,旧 TK1151 缓存保持隔离。

证据边界:全部数据视图不是把不同项目和不同参考版本强行合并成一个矩阵,而是逐个 RNA-seq 数据集独立计算 log2(value+1) 的 Pearson 相关,再汇总展示候选伙伴。结果只能说明表达模式相似,不能证明调控、互作或因果关系。

数据概览

可用表达矩阵
22
当前范围
全部数据集
纳入查询的数据集
11
候选结果行
2028

本页只汇总当前可用目录中的共表达结果,各研究分别计算,不跨数据集混合样本。仅 3 个样本的相关系数尤其不稳定,不应作为高置信调控证据。TKU 采用每基因、每研究前 200 个候选伙伴的查询缓存,不等同于全库两两网络或实验调控证据。

查询基因与代表表达向量

输入 ID
LXL04_000258
原始 ID
LXL04_000258
TK1151
-
OH-1004
LXL04_000258
代表矩阵 ID
LXL04_000258
代表向量 SD
16 / 0.237
R12M2_1
SRR9095317
36.241
R12M3_2
SRR9095316
35.161
R12M3_1
SRR9095315
34.990
R18M1_1
SRR9095314
51.596
R18M2_1
SRR9095313
35.450
R18M3_1
SRR9095312
51.866
R3M2_1
SRR9095311
43.707
R1M2_1
SRR9095310
50.643
R1M1_1
SRR9095309
51.887
R3M1_1
SRR9095308
42.899
R1M3_1
SRR9095307
54.136
R12M1_1
SRR9095306
32.598
R3M3_1
SRR9095305
40.898
R6M1_1
SRR9095304
38.607
R6M2_1
SRR9095303
39.658
R6M3_1
SRR9095302
40.901

候选共表达伙伴汇总

LXL04_004640
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_026824
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_031103
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_026997
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_000602
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_006087
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_016140
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_036827
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_020650
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_039771
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_031609
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_029931
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_038910
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_027613
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_026850
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_033148
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_017402
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000
LXL04_021964
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM
r=1.000

仅分析参考基因;各数据集保留相关性绝对值最高的 200 个伙伴。阈值筛选作用于这 200 个候选,不代表全基因组所有达标伙伴。下载包含当前筛选的全部缓存候选,不受分页影响。

下载全部筛选候选

显示 1–50 / 2028 · 第 1/41 下一页

数据集 参考 矩阵 ID 共表达伙伴 r|r|方向排名样品数方法
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_004640 1.0000 1.0000 正相关 1 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_026824 1.0000 1.0000 正相关 2 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_031103 1.0000 1.0000 正相关 3 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_026997 1.0000 1.0000 正相关 4 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_000602 1.0000 1.0000 正相关 5 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_006087 1.0000 1.0000 正相关 6 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_016140 1.0000 1.0000 正相关 7 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_036827 1.0000 1.0000 正相关 8 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_020650 1.0000 1.0000 正相关 9 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_039771 1.0000 1.0000 正相关 10 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_031609 1.0000 1.0000 正相关 11 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_029931 1.0000 1.0000 正相关 12 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_038910 1.0000 1.0000 正相关 13 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_027613 1.0000 1.0000 正相关 14 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_026850 1.0000 1.0000 正相关 15 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_033148 1.0000 1.0000 正相关 16 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_017402 1.0000 1.0000 正相关 17 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_021964 1.0000 1.0000 正相关 18 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_017684 1.0000 1.0000 正相关 19 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_004144 1.0000 1.0000 正相关 20 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_007517 1.0000 1.0000 正相关 21 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_014489 1.0000 1.0000 正相关 22 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_024033 1.0000 1.0000 正相关 23 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_026410 1.0000 1.0000 正相关 24 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_028989 1.0000 1.0000 正相关 25 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_030045 1.0000 1.0000 正相关 26 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_004277 1.0000 1.0000 正相关 27 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_030760 1.0000 1.0000 正相关 28 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_012933 1.0000 1.0000 正相关 29 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_002187 1.0000 1.0000 正相关 30 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_005741 1.0000 1.0000 正相关 31 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_024963 1.0000 1.0000 正相关 32 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_002172 1.0000 1.0000 正相关 33 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_002600 1.0000 1.0000 正相关 34 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_023710 -1.0000 1.0000 负相关 35 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_033785 1.0000 1.0000 正相关 36 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_029372 1.0000 1.0000 正相关 37 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_022530 1.0000 1.0000 正相关 38 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_038527 1.0000 1.0000 正相关 39 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_017277 -1.0000 1.0000 负相关 40 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_004429 1.0000 1.0000 正相关 41 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_013897 1.0000 1.0000 正相关 42 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_011335 1.0000 1.0000 正相关 43 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_024022 1.0000 1.0000 正相关 44 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_017579 1.0000 1.0000 正相关 45 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_035459 1.0000 1.0000 正相关 46 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_036509 0.9999 0.9999 正相关 47 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
DRA_unassigned_DRR_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_016383 -0.9999 0.9999 负相关 1 4 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_035678 0.9999 0.9999 正相关 48 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only
PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM OH-1004 LXL04_000258 LXL04_015100 0.9999 0.9999 正相关 49 3 Pearson r on log2(value+1); reference genes only

按数据集查看

PRJNA539838_OH1004_RNAseq_TPM

OH-1004 · 16 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 200 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_032057-0.97880.9788116
LXL04_0363830.97820.9782216
LXL04_027595-0.97420.9742316
LXL04_0205860.96810.9681416
LXL04_0204070.96690.9669516
LXL04_0363860.96300.9630616
LXL04_026243-0.95960.9596716
LXL04_0356440.95730.9573816
LXL04_0084090.95700.9570916
LXL04_031512-0.95660.95661016

PRJNA1262623_OH1004_RNAseq_TPM

OH-1004 · 15 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 200 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_0073190.99440.9944115
LXL04_007944-0.99420.9942215
LXL04_0312840.99350.9935315
LXL04_0120280.99310.9931415
LXL04_0362000.99280.9928515
LXL04_014569-0.99240.9924615
LXL04_022300-0.99200.9920715
LXL04_013275-0.99170.9917815
LXL04_0145680.99140.9914915
LXL04_0230970.99110.99111015

PRJNA1490093_OH1004_RNAseq_TPM

OH-1004 · 15 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 200 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_0292530.97310.9731115
LXL04_0190370.97100.9710215
LXL04_0261230.97080.9708315
LXL04_0196250.96490.9649415
LXL04_0211850.96410.9641515
LXL04_0300330.96140.9614615
LXL04_0261150.96110.9611715
LXL04_0276520.95990.9599815
LXL04_0215380.95980.9598915
LXL04_0329000.95920.95921015

PRJNA827459_OH1004_RNAseq_TPM

OH-1004 · 15 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 28 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_0104060.80830.8083115
LXL04_027029-0.77460.7746215
LXL04_0339640.76860.7686315
LXL04_0387880.76320.7632415
LXL04_038432-0.76310.7631515
LXL04_0100290.75790.7579615
LXL04_0195410.75630.7563715
LXL04_004321-0.75440.7544815
LXL04_0358470.74440.7444915
LXL04_0258370.74320.74321015

PRJDB36270_OH1004_RNAseq_TPM

OH-1004 · 9 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 200 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_029499-0.99670.996719
LXL04_0121850.98750.987529
LXL04_024201-0.98720.987239
LXL04_0273330.98700.987049
LXL04_0267740.98660.986659
LXL04_0036110.98630.986369
LXL04_027457-0.98600.986079
LXL04_0379170.98580.985889
LXL04_029685-0.98460.984699
LXL04_013219-0.98440.9844109

PRJNA745038_OH1004_RNAseq_TPM

OH-1004 · 9 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 200 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_003908-0.99240.992419
LXL04_015825-0.99140.991429
LXL04_038274-0.99090.990939
LXL04_031279-0.99060.990649
LXL04_034614-0.98990.989959
LXL04_018844-0.98980.989869
LXL04_028453-0.98970.989779
LXL04_026198-0.98800.988089
LXL04_024501-0.98750.987599
LXL04_013821-0.98740.9874109

PRJNA931633_OH1004_RNAseq_TPM

OH-1004 · 9 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 200 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_015979-0.99820.998219
LXL04_0279760.99810.998129
LXL04_029232-0.99800.998039
LXL04_030400-0.99710.997149
LXL04_017973-0.99710.997159
LXL04_012419-0.99700.997069
LXL04_010620-0.99670.996779
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LXL04_029018-0.99650.996599
LXL04_028230-0.99650.9965109

PRJNA918839_OH1004_RNAseq_TPM

OH-1004 · 6 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 200 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_0300780.99690.996916
LXL04_0277690.99480.994826
LXL04_013871-0.99480.994836
LXL04_0284200.99470.994746
LXL04_0047500.99420.994256
LXL04_0071950.99420.994266
LXL04_012217-0.99330.993376
LXL04_0264800.99050.990586
LXL04_036039-0.99010.990196
LXL04_0231560.98900.9890106

DRA_unassigned_DRR_OH1004_RNAseq_TPM

OH-1004 · 4 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 200 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_016383-0.99990.999914
LXL04_0288500.99990.999924
LXL04_034465-0.99990.999934
LXL04_024294-0.99980.999844
LXL04_007780-0.99980.999854
LXL04_007794-0.99970.999764
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LXL04_0210990.99960.999684
LXL04_008828-0.99950.999594
LXL04_013381-0.99950.9995104

PRJNA413689_OH1004_RNAseq_TPM

OH-1004 · 3 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 200 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_0046401.00001.000013
LXL04_0268241.00001.000023
LXL04_0311031.00001.000033
LXL04_0269971.00001.000043
LXL04_0006021.00001.000053
LXL04_0060871.00001.000063
LXL04_0161401.00001.000073
LXL04_0368271.00001.000083
LXL04_0206501.00001.000093
LXL04_0397711.00001.0000103

PRJNA745038_MeJA_laticifer_RNAseq

OH-1004 · 9 样品 · 矩阵 ID LXL04_000258 · 候选 200 · 此处预览前 10 条;完整候选见上方分页与下载。

伙伴r|r|排名样品数
LXL04_017793-0.99570.995719
LXL04_0002820.99020.990229
LXL04_030528-0.99010.990139
LXL04_006853-0.98810.988149
LXL04_007050-0.98540.985459
LXL04_028590-0.98520.985269
LXL04_0008140.98490.984979
LXL04_033516-0.98460.984689
LXL04_013368-0.98430.984399
LXL04_005174-0.98330.9833109