基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkAUNG003990 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | ChrUn:1231712-1235065 (+) |
| 描述 | Similar to SMO1-2: Methylsterol monooxygenase 1-2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005817 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g22756 |
非血红素铁氧化酶,参与甾醇生物合成,通过催化去除C-4位的第一个甲基基团(通过相似性推测)。 | |
At4g12110 |
非血红素铁氧化酶,通过催化去除 C-4 位的第一个甲基参与类固醇生物合成。 | |
At4g22755 |
非血红素铁氧化酶,参与甾醇生物合成,通过催化去除C-4位的第一个甲基基团(通过相似性推测)。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g07420 |
非血红素铁氧化酶,参与类固醇生物合成,通过催化去除C-4位置的第二个甲基。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os10g0545200 |
醛脱羰酶参与醛向烷烃的转化。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.701; 覆盖度=86.395; E 值=6.84e-70; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016126 | sterol biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.779; 覆盖度=98.299; E 值=2.42e-166; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055089 | fatty acid homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.779; 覆盖度=98.299; E 值=2.42e-166; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055092 | sterol homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.779; 覆盖度=98.299; E 值=2.42e-166; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080064 | 4,4-dimethyl-9beta,19-cyclopropylsterol oxidation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.779; 覆盖度=98.299; E 值=2.42e-166; UniProt GO evidence=NAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080065 | 4-alpha-methyl-delta7-sterol oxidation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.701; 覆盖度=86.395; E 值=6.84e-70; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.894; 覆盖度=99.66; E 值=8.67e-150; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.779; 覆盖度=98.299; E 值=2.42e-166; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.779; 覆盖度=98.299; E 值=2.42e-166; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.701; 覆盖度=86.395; E 值=6.84e-70; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.819; 覆盖度=101.361; E 值=2.16e-164; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000254 | C-4 methylsterol oxidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.779; 覆盖度=98.299; E 值=2.42e-166; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005506 | iron ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.779; 覆盖度=98.299; E 值=2.42e-166; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071771 | aldehyde oxygenase (deformylating) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.729; 覆盖度=98.98; E 值=9.15e-148; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0102177 | 24-methylenelophenol methyl oxidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.894; 覆盖度=99.66; E 值=8.67e-150; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G07420 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.701; 覆盖度=86.395; E 值=6.84e-70 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G12110 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.819; 覆盖度=101.361; E 值=2.16e-164 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G22755 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.894; 覆盖度=99.66; E 值=8.67e-150 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G22756 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.779; 覆盖度=98.299; E 值=2.42e-166 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os10g0545200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.729; 覆盖度=98.98; E 值=9.15e-148 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4349278 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.729; 覆盖度=98.98; E 值=9.15e-148 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |