基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G212950 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:55709814-55713551 (-) |
| 描述 | Similar to At2g44130: F-box/kelch-repeat protein At2g44130 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032907 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g44130 |
F-盒/凯尔奇重复蛋白 At2g44130。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g15670 |
F-盒/Kelch重复蛋白At1g15670。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g59940 |
SCF(ASK-cullin-F-box) E3 泛素连接酶复合物的组成部分,可能介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g30090 |
F-box/kelch重复蛋白 At1g30090。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g67480 |
F-盒/kelch重复蛋白 At1g67480。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009611 | response to wounding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.778; 覆盖度=77.364; E 值=3.85e-56; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.644; 覆盖度=83.668; E 值=2.05e-54; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080037 | negative regulation of cytokinin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.275; 覆盖度=85.387; E 值=1.14e-66; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000762 | regulation of phenylpropanoid metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.275; 覆盖度=85.387; E 值=1.14e-66; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.813; 覆盖度=104.011; E 值=1.14e-62; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.275; 覆盖度=85.387; E 值=1.14e-66; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.275; 覆盖度=85.387; E 值=1.14e-66; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019005 | SCF ubiquitin ligase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.778; 覆盖度=77.364; E 值=3.85e-56; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G15670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.813; 覆盖度=104.011; E 值=1.14e-62 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G16250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.205; 覆盖度=78.223; E 值=1.89e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G80440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.778; 覆盖度=77.364; E 值=3.85e-56 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G44130 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.275; 覆盖度=85.387; E 值=1.14e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G59940 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.644; 覆盖度=83.668; E 值=2.05e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |