本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDTkA08G190580
当前查询版本TK1151
位置Chr08:49805028-49805876 (+)
描述Similar to ATL1: RING-H2 finger protein ATL1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_032599 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g35910 RING-H2 锌指蛋白 ATL70。 暂无已核实直接文献
At4g15975 可能参与植物防御信号通路的早期阶段。 暂无已核实直接文献
At5g05810 RING-H2 指蛋白 ATL43。 暂无已核实直接文献
At5g58580 RING-H2指蛋白 ATL63。 暂无已核实直接文献
At2g27940 RING-H2指蛋白ATL57。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009555pollen development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.261; 覆盖度=41.667; E 值=3.66e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009901anther dehiscence生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.261; 覆盖度=41.667; E 值=3.66e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=53.261; E 值=1.13e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048443stamen development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.261; 覆盖度=41.667; E 值=3.66e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0080141regulation of jasmonic acid biosynthetic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.261; 覆盖度=41.667; E 值=3.66e-19; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.823; 覆盖度=89.855; E 值=4.44e-20; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=28.571; 覆盖度=86.232; E 值=1.47e-20; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016020membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=53.261; E 值=1.13e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004842ubiquitin-protein transferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.778; 覆盖度=58.696; E 值=3.48e-20; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=53.261; E 值=1.13e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=53.261; E 值=1.13e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G04360KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=30.612; 覆盖度=53.261; E 值=1.13e-21UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G17905KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.823; 覆盖度=89.855; E 值=4.44e-20UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G05280KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=38.261; 覆盖度=41.667; E 值=3.66e-19UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G17600KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=28.571; 覆盖度=86.232; E 值=1.47e-20UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os04g0590900KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.778; 覆盖度=58.696; E 值=3.48e-20UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release