基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G189110 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:49404614-49405162 (+) |
| 描述 | Similar to ERF024: Ethylene-responsive transcription factor ERF024 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032573 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g36450 |
可能充当转录激活因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g63040 |
可能充当转录激活因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g25490 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2WZI4 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0968800 |
特异性结合 DNA 序列 5'-[AG]CCGAC-3' 的转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.749; 覆盖度=95.213; E 值=6e-52; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.368; 覆盖度=90.957; E 值=2.99e-36; UniProt GO evidence=IMP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009414 | response to water deprivation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.368; 覆盖度=90.957; E 值=2.99e-36; UniProt GO evidence=IEP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009631 | cold acclimation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.368; 覆盖度=90.957; E 值=2.99e-36; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009738 | abscisic acid-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.848; 覆盖度=87.766; E 值=8.1e-39; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009873 | ethylene-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.749; 覆盖度=95.213; E 值=6e-52; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019760 | glucosinolate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.848; 覆盖度=87.766; E 值=8.1e-39; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.368; 覆盖度=90.957; E 值=2.99e-36; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050832 | defense response to fungus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.749; 覆盖度=95.213; E 值=6e-52; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.749; 覆盖度=95.213; E 值=6e-52; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.848; 覆盖度=87.766; E 值=8.1e-39; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.749; 覆盖度=95.213; E 值=6e-52; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.749; 覆盖度=95.213; E 值=6e-52; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G36450 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.749; 覆盖度=95.213; E 值=6e-52 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G25490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=47.368; 覆盖度=90.957; E 值=2.99e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G51990 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.848; 覆盖度=87.766; E 值=8.1e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0968800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=47.403; 覆盖度=81.915; E 值=2.89e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |