基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G178930 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:46860672-46861106 (-) |
| 描述 | Similar to RPS16: 40S ribosomal protein S16 (Fritillaria agrestis OX%3D64177) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_017397 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000462 | maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.517; 覆盖度=100.0; E 值=7.74e-90; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.517; 覆盖度=100.0; E 值=7.74e-90; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.331; 覆盖度=95.862; E 值=2.63e-87; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.331; 覆盖度=95.862; E 值=2.63e-87; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.331; 覆盖度=95.862; E 值=2.63e-87; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.331; 覆盖度=95.862; E 值=2.63e-87; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.331; 覆盖度=95.862; E 值=2.63e-87; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=85.612; 覆盖度=95.862; E 值=4.49e-87; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022626 | cytosolic ribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.331; 覆盖度=95.862; E 值=2.63e-87; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022627 | cytosolic small ribosomal subunit | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.517; 覆盖度=100.0; E 值=7.74e-90; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.517; 覆盖度=100.0; E 值=7.74e-90; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.331; 覆盖度=95.862; E 值=2.63e-87; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=85.517; 覆盖度=100.0; E 值=7.74e-90; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G09990 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=86.331; 覆盖度=95.862; E 值=2.63e-87 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G18380 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=85.612; 覆盖度=95.862; E 值=4.49e-87 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |