基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G163850 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:42755889-42757013 (-) |
| 描述 | Protein of unknown function |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032289 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0439800 |
参与控制根生长角度。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009630 | gravitropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.018; 覆盖度=95.638; E 值=4.71e-71; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009958 | positive gravitropism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.175; 覆盖度=88.255; E 值=1.71e-86; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0040008 | regulation of growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=58.175; 覆盖度=88.255; E 值=1.71e-86; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080181 | lateral root branching | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.018; 覆盖度=95.638; E 值=4.71e-71; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.018; 覆盖度=95.638; E 值=4.71e-71; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.018; 覆盖度=95.638; E 值=4.71e-71; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009501 | amyloplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.018; 覆盖度=95.638; E 值=4.71e-71; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G17400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.392; 覆盖度=97.651; E 值=2.52e-64 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G72490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.018; 覆盖度=95.638; E 值=4.71e-71 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0439800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.962; 覆盖度=88.926; E 值=5.87e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mtr:25500557 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.846; 覆盖度=87.248; E 值=5.22e-77 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |