基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G105540 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:27374195-27375406 (-) |
| 描述 | Similar to FAB1D: Putative 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase FAB1D (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_031416 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g34260 |
PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g33240 |
PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 |
Arabidopsis FAB1/PIKfyve proteins are essential for development of viable pollen.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.146159
|
At1g71010 |
PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g14270 |
PI(3,5)P2 调节复合物调节磷脂酰肌醇 3,5-二磷酸 (PtdIns(3,5)P2) 的合成和周转。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007033 | vacuole organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.96; 覆盖度=43.701; E 值=4.51e-156; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046854 | phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.96; 覆盖度=43.701; E 值=4.51e-156; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.96; 覆盖度=43.701; E 值=4.51e-156; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010008 | endosome membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.96; 覆盖度=43.701; E 值=4.51e-156; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000285 | 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.96; 覆盖度=43.701; E 值=4.51e-156; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.96; 覆盖度=43.701; E 值=4.51e-156; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G34260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.96; 覆盖度=43.701; E 值=4.51e-156 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |