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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA08G101750
当前查询版本TK1151
位置Chr08:26395277-26396860 (-)
描述Similar to PCMP-E29: Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g21470 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_031331 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g49142 推定含五重复肽的蛋白质 At3g49142。 暂无已核实直接文献
At1g11290 参与叶绿体中多个位点的RNA编辑事件。
At5g56310 含五肽重复蛋白 At5g56310。 暂无已核实直接文献
At2g20540 含五螺旋肽重复的蛋白 At2g20540。 暂无已核实直接文献
At5g52630 假定含五聚肽重复序列蛋白 At5g52630。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.22; 覆盖度=96.395; E 值=2.61e-107; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009451RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.915; 覆盖度=96.205; E 值=1.17e-166; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016556mRNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.22; 覆盖度=96.395; E 值=2.61e-107; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1900865chloroplast RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.22; 覆盖度=96.395; E 值=2.61e-107; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005773vacuole细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.22; 覆盖度=96.395; E 值=2.61e-107; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.915; 覆盖度=96.205; E 值=1.17e-166; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.915; 覆盖度=96.205; E 值=1.17e-166; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.701; 覆盖度=98.861; E 值=3.58e-114; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G45350KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.22; 覆盖度=96.395; E 值=2.61e-107UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G21470KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.915; 覆盖度=96.205; E 值=1.17e-166UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G29230KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.701; 覆盖度=98.861; E 值=3.58e-114UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release