基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G098210 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:25420150-25421256 (+) |
| 描述 | Similar to ndhM: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M%2C chloroplastic (Populus jackii OX%3D640484) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_031268 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010258 | NADH dehydrogenase complex (plastoquinone) assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=67.978; 覆盖度=83.568; E 值=1.24e-82; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=67.978; 覆盖度=83.568; E 值=1.24e-82; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=67.978; 覆盖度=83.568; E 值=1.24e-82; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.863; 覆盖度=102.817; E 值=1.16e-97; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010598 | NAD(P)H dehydrogenase complex (plastoquinone) | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=67.978; 覆盖度=83.568; E 值=1.24e-82; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016655 | oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H, quinone or similar compound as acceptor | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.863; 覆盖度=102.817; E 值=1.16e-97; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048038 | quinone binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.863; 覆盖度=102.817; E 值=1.16e-97; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G37925 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=67.978; 覆盖度=83.568; E 值=1.24e-82 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0539000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=71.429; 覆盖度=75.587; E 值=1.51e-79 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |