基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G058990 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:15099268-15100751 (+) |
| 描述 | Similar to At3g12180: Protein cornichon homolog 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018414 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g12180 |
蛋白 cornichon 同源物 1。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g12390 |
蛋白cornichon同源物4。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g12340 |
可能的蛋白质 cornichon 同源物 2。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0506400 |
作为货物受体,必需用于将分泌蛋白从内质网(ER)通过COPII被膜囊泡运输至高尔基体。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0136500 |
可能作为货物受体,介导 HKT1;3 等蛋白从内质网向高尔基体的囊泡运输。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016192 | vesicle-mediated transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=94.0; E 值=7.93e-56; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=47.857; 覆盖度=93.333; E 值=2.72e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=47.857; 覆盖度=93.333; E 值=2.72e-43; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.0; 覆盖度=89.333; E 值=3.52e-42; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=94.0; E 值=7.93e-56; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005102 | signaling receptor binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=94.0; E 值=7.93e-56; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0038024 | cargo receptor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.271; 覆盖度=71.333; E 值=1.58e-38; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G12340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.333; 覆盖度=80.0; E 值=2.86e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G12390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.0; 覆盖度=89.333; E 值=3.52e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G12180 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.482; 覆盖度=94.0; E 值=7.93e-56 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0136500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.271; 覆盖度=71.333; E 值=1.58e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0506400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=47.857; 覆盖度=93.333; E 值=2.72e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4352293 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=47.857; 覆盖度=93.333; E 值=2.72e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |