基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G050550 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:12888537-12891031 (-) |
| 描述 | Similar to XBAT31: Putative E3 ubiquitin-protein ligase XBAT31 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_017793 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g28840 |
当与E2酶UBC8在体外结合时,未观察到E3泛素-蛋白连接酶活性。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os05g0112000 |
E3 泛素蛋白连接酶,需用于 XA21 LRR 受体激酶的充分积累及 XA21 介导的抗病性。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0974400 |
可能的 E3 泛素-蛋白连接酶 XBOS31。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009408 | response to heat | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.176; 覆盖度=104.598; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.176; 覆盖度=104.598; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042742 | defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.806; 覆盖度=103.218; E 值=5.46e-180; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051865 | protein autoubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.806; 覆盖度=103.218; E 值=5.46e-180; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.176; 覆盖度=104.598; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.176; 覆盖度=104.598; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004842 | ubiquitin-protein transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.806; 覆盖度=103.218; E 值=5.46e-180; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.176; 覆盖度=104.598; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.176; 覆盖度=104.598; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G28840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.176; 覆盖度=104.598; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0974400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.054; 覆盖度=102.069; E 值=6.6e-150 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0791200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.796; 覆盖度=94.713; E 值=9.73e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0112000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.806; 覆盖度=103.218; E 值=5.46e-180 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0258200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.731; 覆盖度=95.632; E 值=5.6e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |