基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G007550 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:1901091-1903126 (+) |
| 描述 | Similar to VIT_05s0020g04080: 1%2C2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase 2 (Vitis vinifera OX%3D29760) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_034353 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g14710 |
催化氧与酸还原酮 1,2-二羟基-3-酮-5-甲硫戊烯(DHK-MTPene)之间的两种不同反应,具体取决于活性位点中结合的金属。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g14716 |
催化氧与酸还原酮 1,2-二羟基-3-酮-5-甲硫戊烯(DHK-MTPene)之间的两种不同反应,具体取决于活性位点中结合的金属。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g26400 |
催化氧与酸还原酮 1,2-二羟基-3-酮-5-甲硫戊烯(DHK-MTPene)之间的两种不同反应,具体取决于活性位点中结合的金属。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2XCT8 |
催化氧与酸还原酮 1,2-二羟基-3-酮-5-甲硫戊烯(DHK-MTPene)之间的两种不同反应,具体取决于活性位点中结合的金属。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006555 | methionine metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=72.727; E 值=1.18e-126; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019509 | L-methionine salvage from methylthioadenosine | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=72.727; E 值=1.18e-126; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051302 | regulation of cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.854; 覆盖度=69.818; E 值=9.1e-123; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=72.727; E 值=1.18e-126; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=72.727; E 值=1.18e-126; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=82.915; 覆盖度=72.364; E 值=2.01e-125; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=82.915; 覆盖度=72.364; E 值=2.01e-125; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005506 | iron ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=72.727; E 值=1.18e-126; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010308 | acireductone dioxygenase (Ni2+-requiring) activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=72.727; E 值=1.18e-126; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010309 | acireductone dioxygenase [iron(II)-requiring] activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=72.727; E 值=1.18e-126; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016151 | nickel cation binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=86.0; 覆盖度=72.727; E 值=1.18e-126; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G14710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=82.915; 覆盖度=72.364; E 值=2.01e-125 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14716 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=83.854; 覆盖度=69.818; E 值=9.1e-123 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0161800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=77.157; 覆盖度=71.636; E 值=1.91e-115 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |